Jan Cordius (født 12. april 1966) er en tidligere dansk atlet.
Cordius var frem til och med 1992 medlem af Fredensborg AK derefter i Sparta Atletik. Han deltog i VM i Gøteborg 1995i diskoskast. Han er indehaver af den danske rekord i kastefemkamp med 4895 point sat 4. juni 1995 og har haft den danske rekord i hammerkast. Han har vundet 15 danske mesterskaber. Efter karriernen som kaster har han gennemført et maratonløb
Cordius er uddannet som Ergoterapeut og har blandt andet arbejdet på Bispebjerg Hospital. Har tidligere arbejdet 18 år for Nike Danmark. I dag er han selvstændig og laver sensomotoriske ortopædiske indlægssåler.