Han er medstifter af Tænketanken Cevea, hvor han var direktør fra 2008 til 2011 og analysechef fra 2011 til 2015. I samme periode, som han varetog direktørposten, var han ansat som ph.d.-stipendiat ved CBS, hvor hans vejleder var professor Ove Kaj Pedersen, der samtidigt var medlem af Ceveas bestyrelse.[kilde mangler]
Steen Madsen er i dag Politik- og udviklingschef for Socialdemokratiet, som han også tidligere har arbejdet for i Bruxelles og på Christiansborg.
Jens Jonatan Steen er politisk debattør og har medvirket i en lang række offentlige debatter i radio og tv, samt dagblade. Han er fast klummeskribent på Berlingske, blogger på jp.dk og har redigeret og bidraget til flere politiske debat- og fagbøger, bl.a. "Political marketing: principles and applications" (2009), ”Velfærd med et menneskeligt ansigt” (2011), ”Højrepopulismen – Venstrefløjens akilleshæl” (2013), "Civilsamhället klämt mellan staten och kapitalet" (2013) og ”DeltagerDanmark” (2013).
Jens Jonatan Steen er uddannet sergent ved Militærpolitiet og var i hæren fra 2000-2002.
Jens Jonatan Steen har lavet en del frivilligt arbejde, bl.a. som underviser i Danmarks Socialdemokratiske Ungdom (DSU), som valgobservatør for Silba i Hviderusland, som ansvarlig for projektet og tidsskriftet ”Dijalog” i Bosnien og som redaktør på det idépolitiske centrum-venstre magasin VISION (2004-2008).
Han er tidligere formand for Studenterforeningen Frit Forum Roskilde (2003-2006) og tidligere medlem af Akademisk Råd på RUC (2005-2006).
12jena (17. september 2008). "Jens Steen i spidsen for tænketank". Midtjyllands Avis. s.2.{{cite news}}: |access-date= kræver at |url= også er angivet (hjælp)
