Tarmfloraen (ordet er misvisende og forkert, da tyktarmsbakterier ikke tilhører planteriget), som på moderne dansk også kaldes tarmens mikrobiom (på engelsk the gut microbiome eller the gut microbiota), er de mikroorganismer, protister, bakterier og svampe, der befinder sig i mave-tarm-kanalen. Langt tid før 2016 er det anbefalede navn tarmmikrobiota. Tarmbakterierne udgør langt størstedelen af menneskets mikrobiom eller mikrobiota. Hos mennesker etableres tarmfloraen ved fødslen igennem munden og vedligeholdes gennem livet ved indtagelse af føde m.m. Tarmfloraen udgør en betydelig del af det humane mikrobiom, dvs. de mikroorganismer, der lever på og i den menneskelige organisme. Mave-tarm-kanalen indeholder normalt op til 1,5 kg bakterier svarende til 100 billioner bakterie-celler, ca 10 gange det antal celler som mennesket består af.
Tarmfloraen deltager aktivt i fordøjelsen af føden vi spiser, stimulerer immunsystemet og bekæmper patogene organismer og der er i den seneste tid (2013) blevet sat fokus på tarmfloraen som en stor kemikalie-fabrik, der ikke bare leverer vitaminer og hormon-aktive stoffer, men som også spiller en rolle i sygdomme og fedme.
Der er store individuelle forskelle mellem menneskers tarmflora, men der er blevet skelnet mellem tre forskellige typer tarmflora, der også kaldes "økosystemer" eller "enterotyper". Hver enterotype er karakteriseret af et højt indhold af en bestemt bakterie-art, for enterotype 1 er det Bacteroides, for enterotype 2 Prevotella og enterotype 3 Ruminococcus, der er den dominerende.
Danske forskere har gjort en stor indsats for at kortlægge europæernes tarmflora.[behøver bedre kilde] Der er dog fortsat kun sporadisk viden om langt de fleste af tarmens mikroorganismer, delvis på grund af at de er anaerobe og vanskelige at dyrke in vitro.
Tarmfloraens typiske eksempler
Tarmfloraen består af mange forskellige arter, og ved analyser er der identificeret ca. 2000 arter, hvoraf et menneske har ca. 500 forskellige arter. Nogle af tarmfloraens typiske eksempler er
Type 1 er udpræget hos vesterlændinge der spiser meget protein og dyrisk fedt, hvorimod Type 3 er udpræget hos mennesker der spiser fiberrig kost med kulhydrater.
Enterotyperne menes at have betydning for en persons sygdomsrisiko og for responset overfor antibiotika og andre farmaka
Tarmfloraen og sundhed
Stimulering af immunsystemet
Bekæmpelse af patogene mikroorganismer
Produktion af vitaminer (K-vitamin og B-vitaminerne biotin og pantotensyre), hormoner og hormonlignende stoffer
Nedbrydning af føden
Der er også tegn på at tarmens mikrobiom kan hænge sammen med autisme, idet den ualmindelige bakterie Sutterella er fundet hos autistiske børn.
123politiken.dk: 14. jul. 2016, politiken.dk: »Grøn kost ændrer dine tarmbakterier på 48 timer« Citat: "...Det eneste, videnskaben ved om den mest markante af de to bakteriearter fra studiet, Prevogella copri, er, at der er sammenhæng mellem bakterien og betændelsestilstande i tarmene – inflammation. Bakterien sættes også i forbindelse med leddegigt, også en inflammatorisk sygdom...Professor: Drop nu ordet ’tarmflora’. Ordet ’tarmflora’ er fejlagtigt, gammeldags og vildledende. Ifølge professor og forskningsdirektør Oluf Borbye Pedersen er det »rigtig mange år siden siden, at videnskabsfolk troede, at bakterier var en del af planteriget. Derfor er det fejlagtigt, når sammensætningen af tarmbakterier i tarmen kaldes for tarmflora. Det rette ord er ’mikrobiota’«, siger han...", backup
↑NYU Langone Medical Center. (2014, November 19). Natural gut viruses join bacterial cousins in maintaining health and fighting infections. ScienceDaily Citat: "...In a series of experiments in mice that took two years to complete, the NYU Langone team found that infection with the common murine norovirus, or MNV, helped mice repair intestinal tissue damaged by inflammation and helped restore the gut's immune defenses after its microbiome had been wiped out by antibiotic therapy. In a report on their work to be published in the journal Nature online Nov. 19, researchers say they also found that MNV bolstered the immune system in fighting off tissue damage..."