Grüne Nichtschwefelbakterien
| Grüne Nichtschwefelbakterien | ||||||||
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REM-Aufnahmen von Dictyobacter halimunensis (Stamm S3.2.2.5T). Mutmaßliche Sporangienstrukturen (a), Pfeil zeigt sporangiophoreähnliche Struktur (b), glatte Textur des mutmaßlichen Sporangiums (c), Masse fragmentierter Hyphen, die das mutmaßliche Sporangium bedecken (d). Alle Balken 4 µm. | ||||||||
| Systematik | ||||||||
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||
| Chloroflexota | ||||||||
| Garrity & Holt 2021 |
Das Phylum (Abteilung) Chloroflexota (Grüne Nichtschwefelbakterien i. w. S.) ist eine phylogenetisch eigenständige Gruppe von Bakterien im Reich Bacillati (Terrabakterien). Typusklasse ist Chloroflexia (früher wurden Phylum und Klasse beide Chloroflexi genannt). Sie sind von den Grünen Schwefelbakterien (Phylum Chlorobiota) zu unterscheiden. Die Chloroflexota sind gramnegativ und meist filamentös. Alle bisher bekannten Vertreter sind thermophil.
Die Typusgattung Chloroflexus verfügt über die Fähigkeit zur Photosynthese. Die lichtabsorbierenden Pigmente verleihen diesen Bakterien ihre grünliche Farbe. Der Photosyntheseapparat besitzt einen ungewöhnlichen Aufbau. Er verfügt einerseits über Merkmale, die für Grüne Schwefelbakterien (Chlorobiota) typisch sind, wie etwa Chlorosomen und Bacteriochlorophyll c, andererseits aber auch über Bacteriochlorophyll a, das sonst bei Purpurbakterien zu finden ist. Chloroflexus ist metabolisch vielfältig: Die Gattung kann anoxygen photoautotroph wachsen, aber auch photoheterotroph (wie Nichtschwefelpurpurbakterien) und bei Lichtmangel chemoorganotroph. Chloroflexus ist eine aus phylogenetischer Sicht sehr alte Gattung und verfügt über einen einzigartigen Weg der Kohlenstoffassimilation (Hydroxypropionatzyklus).
Die Gattung Thermomicrobium ist chemotroph und wächst bei Temperaturen um 75 °C am besten. Diese Bakterien sind durch ihre ungewöhnliche Zellmembran interessant, deren Lipide im Gegensatz zu anderen Bakterien und Archaeen kein Glycerin enthalten und weder verestert noch verethert sind.
Grüne Nichtschwefelbakterien findet man in heißen Quellen mit neutralen bis hohen pH-Werten, aber auch in marinen Matten.
Systematik
Es folgt eine Liste der Klasse, Ordnungen, Familien und Gattungen:
Klasse Chloroflexia corrig. Gupta et al. 2013 [früher Chloroflexi oder Chlorobacteria, wie auch für die ganze Abteilung]
- Ordnung Chloroflexales Gupta et al. 2013
- Familie Chloroflexaceae Gupta et al. 2013
- Gattung Chloroflexus Pierson & Castenholz 1974
- Gattung „Ca. Chloranaerofilum“ Thiel et al. 2016
- Gattung „Ca. Chloroploca“ Gorlenko et al. 2014 (Klassifizierung nach GTDB)
- Gattung „Ca. Viridilinea“ Grouzdev et al. 2018 bzw. Gaisin et al. 2019 (Klassifizierung nach GTDB)
- Familie Oscillochloridaceae Keppen et al. 2000
- Gattung Chloronema Dubinina & Gorlenko 1975
- Gattung Oscillochloris Gorlenko & Pivovarova 1989
- Familie Roseiflexaceae Gupta et al. 2013
- Gattung „Ca. Amarofilum“ Petriglieri et al. 1986
- Gattung Heliothrix Pierson et al. 2013
- Gattung „Ca. Kouleothrix“ Klappenbach & Pierson 2004
- Gattung „Ca. Ribeiellam“ Petriglieri et al. 2023
- Gattung Roseiflexus Hanada et al. 2002
- ohne Familienzuordnung
- Gattung „Ca. Chlorotrichoides“ corrig. Klappenbach & Pierson 2004 [„Ca. Chlorotrix“ Klappenbach & Pierson 2004]
- Gattung „Ca. Lithoflexus“ Saghaï et al.2020
- Familie Chloroflexaceae Gupta et al. 2013
- Ordnung Herpetosiphonales Gupta et al. 2013
- Familie Herpetosiphonaceae Gupta et al. 2013
- Gattung Herpetosiphon Holt & Lewin 1968
- Gattung „Ca. Anthektikosiphon“ Ward et al. 2020
- Familie Herpetosiphonaceae Gupta et al. 2013
- Ordnung Kallotenuales Cole et al. 2013
- Familie Kallotenuaceae Cole et al. 2013
- Gattung Kallotenue Cole et al. 2013
- Familie Kallotenuaceae Cole et al. 2013
- Ordnung „Ca. Thermobaculales“ Chuvochina et al. 2023
- Familie „Ca. Thermobaculaceae“ Chuvochina et al. 2023
- Gattung „Thermobaculum“ Botero et al. 2004 [„Ca. Thermobaculum“ Chuvochina et al. 2023]
- Familie „Ca. Thermobaculaceae“ Chuvochina et al. 2023
Klasse Anaerolineae Yamada et al. 2006
- Ordnung Aggregatilineales Nakahara et al. 2019
- Familie Aggregatilineaceae Nakahara et al. 2019
- Gattung Aggregatilinea Nakahara et al. 2019
- Familie „Ca. Flexifilaceae“ Petriglieri et al.2023
- Familie Aggregatilineaceae Nakahara et al. 2019
- Ordnung Aggregatilineales Yamada et al. 2006
- Familie Anaerolineaceae Yamada et al. 2006 [„Ca. Villigracilaceae“ Petriglieri et al. 2023]
- Gattung Anaerolinea Sekiguchi et al. 2003
- Gattung Bellilinea Yamada et al. 2007
- Gattung Leptolinea Yamada et al. 2006
- Gattung Levilinea Yamada et al. 2006
- Gattung Longilinea Yamada et al. 2007
- Gattung Pelolinea Imachi et al. 2014
- Gattung …
- Familie Anaerolineaceae Yamada et al. 2006 [„Ca. Villigracilaceae“ Petriglieri et al. 2023]
- Ordnung „Ca. Epilineales“ Petriglieri et al. 2023
- Ordnung „Ca. Promineifilales“ Chuvochina et al. 2023
Klasse Caldilineae Yamada et al. 2006
- Ordnung Caldilineales Yamada et al. 2006
- Familie „Ca. Candidatus Amarolineaceae“ Andersen et al. 2019
- Familie Caldilineacea Yamada et al. 2006
- Gattung Caldilinea Sekiguchi et al. 2003
- Gattung „Ca. Fredericiella“ Petriglieri et al. 2023
- Gattung Litorilinea Kale et al. 2013
Klasse Dehalococcoidia Löffler et al. 2013 [„Dehalococcoidetes“ Hugenholtz & Stackebrandt 2004]
- Ordnung Dehalococcoidales Löffler et al. 2013
- Familie Dehalococcoidaceae Löffler et al. 2013
- Gattung Dehalococcoides Löffler et al. 2013
- Gattung Dehalogenimonas Moe et al. 2009
- ohne Familienzuweisung
- Gattung [Dehalobium] (formal ergänzt), mit Spezies „Dehalobium chlorocoercia“ Kittelmann & Friedrich 2008
- Familie Dehalococcoidaceae Löffler et al. 2013
Zum o__SAR202 innerhalb der Dehalococcoidia gehören folgende Ordnungen:
- Ordnung „Ca. Lucifugimonadales“ Lim et al.2023
- Familie „Ca. Lucifugimonadaceae“ Lim et al.2023
- Gattung „Ca. Lucifugimonas“ Lim et al.2023 (mit „Ca. L. marina“)
- Familie „Ca. Lucifugimonadaceae“ Lim et al.2023
- Ordnung o__SAR202 (nach der GTDB mit ca. 18 Familien)
- ?Ordnung o__SAR202-VII-2 (nach der GTDB mit 1 Familie, nur Stamm SAR202-VII-2, zu Dehalococcoidia, Zuordnung zum SAR202-Cluster Cluster unsicher)
Klasse Ktedonobacteria corrig. Cavaletti et al. 2007 [Ktedobacteria Cavaletti et al. 2007]
- Ordnung Ktedonobacterales corrig. Cavaletti et al. 2007 [Ktedobacterales Cavaletti et al. 2007]
- Familie Dictyobacteraceae Wang et al. 2019
- Gattung Dictyobacter Yabe et al. 2017
- Gattung Tengunoibacter Wang et al. 2019
- Familie Ktedonobacteraceae corrig. Cavaletti et al. 2007 [Ktedobacteraceae Cavaletti et al. 2007]
- Familie Ktedonosporobacteraceae Yan et al. 2020
- Familie Reticulibacteraceae Yabe et al. 2021
- Familie Thermosporotrichaceae Yabe et al. 2010
- Familie Dictyobacteraceae Wang et al. 2019
- Ordnung Thermogemmatisporales Yabe et al. 2011
Klasse „Ca. Limnocylindria“ Mehrshad et al. 2018
Klasse „Ca. Martimicrobiia“ corrig. Williams et al. 2024 [„Ca. Martimicrobia“ Williams et al. 2024]
Klasse „Ca. Monstramaria“ Landry et al. 2017
Klasse „Ca. Poriflexia“ Kogawa et al. 2022
Klasse „Ca. Spiritibacteria“ Williams et al. 2024
Klasse „Ca. Tarhunnaeia“ Williams et al. 2024
Klasse Tepidiformia Kochetkova et al. 2020
- Ordnung Tepidiformales Kochetkova et al. 2020
- Familie Tepidiformaceae Kochetkova et al. 2020
- Gattung „Ca. Amarobacillus“ Petriglieri et al. 2023
- Gattung „Ca. Amarobacter“ Petriglieri et al. 2023
- Gattung Tepidiforma Kochetkova et al. 2020
- Familie Tepidiformaceae Kochetkova et al. 2020
Klasse Thermoflexia Dodsworth et al. 2014
- Ordnung Thermoflexales Dodsworth et al. 2014
- Familie „Ca. Roseilineaceae“ Ward et al. 2021
- Gattung „Ca. Roseilinea“ Thiel et al. 2016
- Familie Thermoflexaceae Dodsworth et al. 2014
- Gattung Thermoflexus Dodsworth et al. 2014
- Familie „Ca. Roseilineaceae“ Ward et al. 2021
Klasse „Ca. Thermofontia“ corrig. Ward et al. 2018 [„Ca. Thermofonsia“ Ward et al. 2018]
Klasse „Ca. Uliximicrobiia“ corrig. Williams et al. 2024 [Klasse „Ca. Uliximicrobia“ Williams et al. 2024]
Klasse „Ca. Umbricyclopia“ Mehrshad et al. 2018
Die Klasse Thermomicrobia wurde früher ebenfalls den Grünen Nichtschwefelbakterien zugewiesen, wird heute aber in ein eigenes Phylum Thermomicrobiota des Reichs Pseudomonadati klassifiziert.
Einzelnachweise
- ↑ LPSN: Phylum Chloroflexota Garrity and Holt 2021.
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: SAR202 cluster
- ↑ GTDB: Dehalococcoidia.