Smacoviridae

Smacoviridae

Smacoviridae

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Floreoviria
Reich: Shotokuvirae
Phylum: Cressdnaviricota
Klasse: Arfiviricetes
Ordnung: Cremevirales
Familie: Smacoviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: (-)ssDNA zirkulär
Baltimore: Gruppe 2
Symmetrie: ikosaedrisch
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Smacoviridae
Links

Smacoviridae ist die Bezeichnung einer Familie von Einzelstrang-DNA-Viren. Das Genom vom Mitgliedern dieser Familie ist zirkulär und klein – die Länge beträgt etwa 2,3–2,8 kb (Kilobasen). Das Genom kodiert für ein Rolling-Circle-Replikationsinitiationsprotein (Rep) und familienspezifische Kapsidproteine. Derzeit (Stand 4. April 2026) sind zwölf Gattungen in dieser Familie vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) anerkannt. Die Viren in diesem Taxon wurden durch Metagenomanalysen aus Fäkalproben von Insekten und Wirbeltieren identifiziert. Über ihre Biologie ist wenig bekannt.

Beschreibung

Genomkarte von „Capybara associated smacovirus“, vorgeschlagenes Mitglied der Smacoviridae aus Capybaras. Ganz oben die Haarnadelstruktur (stem-loop).
Genom (A) eines Vertreters der Smacoviridae mit Ambisense-Typ-IV-Genom (Papio cynocephalus associated smacovirus 3, PcSmV3) und (B) eines anderen mit Unisense-Typ-V-Genom (Papio kindae associated smacovirus-like virus 1, PkSmV1) aus sambischen Steppen- bzw. Kindapavianen mit Darstellung der ORFs (Rep: rolling circle replication-associated protein; CP: Kapsidprotein), Haarnadelstruktur (stem loop, Stammschleife) und Nonanukleotid.

Die Smacoviridae haben ein nicht-segmentiertes, zirkuläres Einzelstrang-Genom mit einer Länge von 2,3–2,8 kb (Kilobasen). Das Genom kodiert für sechs Proteine, darunter ein Replikator (Rep) und ein Kapsidprotein (CP).

Systematik

Die Systematik der Familie ist mit Stand 4. April 2026 wie folgt:

Familie Smacoviridae

000 Die Spezies dieser Gattung im Detail anzeigen:

  • Spezies Porprismacovirus alecas1 mit Alces alces faeces associated smacovirus MP78
  • Spezies Porprismacovirus anati1 mit Cygnus columbianus Smacoviridae sp. swn66sma1
  • Spezies Porprismacovirus avias1 mit Avian associated porprismacovirus BR_DF13
  • Spezies Porprismacovirus avias2 mit Smacoviridae sp. w3chi091cir1
  • Spezies Porprismacovirus babas1 mit Papio cynocephalus associated smacovirus mit Papio cynocephalus associated smacovirus 3 (PcSmV3), Isolat ZM09-74
  • Spezies Porprismacovirus bovas1 (früher Bovine associated porprismacovirus 1) mit Bovine faeces associated smacovirus 2
  • Spezies Porprismacovirus bovas2 mit Cattle blood-associated circovirus-like virus Bvch001
  • Spezies Porprismacovirus bovas3 mit Genomoviridae sp. C025899
  • Spezies Porprismacovirus camas1 (früher Camel associated porprismacovirus 1) mit Dromedary stool-associated circular ssDNA virus c1378
  • Spezies Porprismacovirus camas2 (früher Camel associated porprismacovirus 2) mit Dromedary stool-associated circular ssDNA virus c1072
  • Spezies Porprismacovirus camas3 (früher Camel associated porprismacovirus 3) mit Dromedary stool-associated circular ssDNA virus c1345
  • Spezies Porprismacovirus camas4 (früher Camel associated porprismacovirus 4) mit Dromedary stool-associated circular ssDNA virus c1258
  • Spezies Porprismacovirus camas5 mit Smacoviridae sp. 173Smaco
  • Spezies Porprismacovirus canid1 mit Canine associated porprismacovirus SmacoviridaeDogfe369C1
  • Spezies Porprismacovirus canid2 mit Canine associated porprismacovirus SmacoviridaeDogfe322C1
  • Spezies Porprismacovirus canid3 mit Raccoon dog stool-associated smacovirus 4 CJY7
  • Spezies Porprismacovirus canid4 mit Canine associated porprismacovirus SmacoviridaeDogfe433C1
  • Spezies Porprismacovirus canid5 mit Canine associated porprismacovirus SmacoviridaeDogfe373C1
  • Spezies Porprismacovirus canid6 mit Canine associated porprismacovirus SmacoviridaeDogfe373C1
  • Spezies Porprismacovirus canid7 mit Canine associated porprismacovirus SmacoviridaeDogfe342C1
  • Spezies Porprismacovirus canid8 mit Raccoon dog stool-associated smacovirus 1 CJY4
  • Spezies Porprismacovirus canid9 mit Raccoon dog stool-associated smacovirus 2 CJY5
  • Spezies Porprismacovirus capas1 mit Capybara associated smacovirus 1_cap1_104 alias Capybara associated smacovirus mit Capybara associated smacovirus 1_cap1_104
  • Spezies Porprismacovirus chicas1 mit Chicken associated smacovirus RS/BR/2015/1
  • Spezies Porprismacovirus chicas2 mit Chicken smacovirus mg4_881
  • Spezies Porprismacovirus chicas3 mit Chicken smacovirus mg5_1212
  • Spezies Porprismacovirus chicas4 mit Chicken smacovirus mg4_885
  • Spezies Porprismacovirus chicas5 mit Chicken smacovirus mg7_67
  • Spezies Porprismacovirus chicas6 mit Chicken smacovirus mg4_964
  • Spezies Porprismacovirus chicas7 mit Chicken smacovirus mg5_1081
  • Spezies Porprismacovirus chimas1 (früher Chimpanzee associated porprismacovirus 1) mit Chimpanzee stool associated circular ssDNA virus DP152
  • Spezies Porprismacovirus chimas2 (früher Chimpanzee associated porprismacovirus 2) mit Chimpanzee stool associated circular ssDNA virus GM495
  • Spezies Porprismacovirus envor1 mit Virus sp. D3_464
  • Spezies Porprismacovirus envor2 mit Virus sp. D3_567
  • Spezies Porprismacovirus equid1 mit Smacoviridae D23_Smaco
  • Spezies Porprismacovirus equid2 mit Smacoviridae D33_Smaco_2
  • Spezies Porprismacovirus flas1 mit Fly associated circular virus 4
  • Spezies Porprismacovirus goas1 mit Goat associated porprismacovirus, Isolat 16915x9_1969
  • Spezies Porprismacovirus goras1 (früher Gorilla associated porprismacovirus 1) mit Gorilla smacovirus
  • Spezies Porprismacovirus howas1 (früher Howler monkey associated porprismacovirus 1) mit Black howler monkey smacovirus
  • Spezies Porprismacovirus humas1 (früher Human associated porprismacovirus 1) mit Human feces smacovirus 2
  • Spezies Porprismacovirus humas2 (früher Human associated porprismacovirus 2) mit Chimpanzee smacovirus
  • Spezies Porprismacovirus humas3 mit Human feces smacovirus 3
  • Spezies Porprismacovirus humas4 mit Human associated porprismacovirus 3
  • Spezies Porprismacovirus lemas1 (früher Lemur associated porprismacovirus 1) mit Lemur smacovirus
  • Spezies Porprismacovirus leo1 mit Panthera leo smacovirus 1
  • Spezies Porprismacovirus lynas2 mit Lynx rufus smacovirus 2
  • Spezies Porprismacovirus macas1 mit Macaca mulatta feces associated virus 7
  • Spezies Porprismacovirus macas2 mit Macaca mulatta feces associated virus 4
  • Spezies Porprismacovirus macas3 mit Macaca mulatta feces associated virus 3
  • Spezies Porprismacovirus macas4 mit Macaca mulatta feces associated virus 2
  • Spezies Porprismacovirus macas5 mit Macaque stool associated virus 11
  • Spezies Porprismacovirus macas6 mit Macaca mulatta feces associated virus 10
  • Spezies Porprismacovirus macas7 mit Macaca mulatta feces associated virus 1 cg6982
  • Spezies Porprismacovirus macro1 mit Smacoviridae sp. 167Smaco-1
  • Spezies Porprismacovirus macro2 mit Smacoviridae sp. 171Smaco
  • Spezies Porprismacovirus malbas1 mit Chlorocebus cynosuros associated smacovirus
  • Spezies Porprismacovirus molos1 mit Smacoviridae sp. 164Smaco-1
  • Spezies Porprismacovirus peafo1 mit Smacoviridae sp. bpk075sma01
  • Spezies Porprismacovirus phasi1 mit Chrysolophus pictus Smacoviridae sp. gps222sma2
  • Spezies Porprismacovirus phasi2 mit Pavo cristatus Smacoviridae sp. blp211sma3
  • Spezies Porprismacovirus phasi3 mit Chrysolophus pictus Smacoviridae sp. gps222sma6
  • Spezies Porprismacovirus porci1 (früher Porcine associated porprismacovirus 1) mit Porcine associated stool circular virus
  • Spezies Porprismacovirus porci10 (früher Porcine associated porprismacovirus 10) mit Porcine faeces associated smacovirus 1
  • Spezies Porprismacovirus porci11 mit Porcine associated porprismacovirus 17499x73_1865
  • Spezies Porprismacovirus porci12 mit Porcine associated porprismacovirus 17499x3_679
  • Spezies Porprismacovirus porci13 mit Porcine associated porprismacovirus 17499x80_1385
  • Spezies Porprismacovirus porci14 mit Porcine associated porprismacovirus 17489x67_1878
  • Spezies Porprismacovirus porci15 mit Porcine associated porprismacovirus 17499x75_2040
  • Spezies Porprismacovirus porci16 mit Porcine associated porprismacovirus 17489x75_2609
  • Spezies Porprismacovirus porci17 mit Porcine associated porprismacovirus 17668x35_2540
  • Spezies Porprismacovirus porci18 mit Porcine associated porprismacovirus 17668x43_2798
  • Spezies Porprismacovirus porci19 mit Porcine associated porprismacovirus 17489x27_1438
  • Spezies Porprismacovirus porci2 (früher Porcine associated porprismacovirus 2) mit Porcine stool-associated circular virus 2 und/alias Bovine stool associated circular virus.
  • Spezies Porprismacovirus porci20 mit Porcine associated porprismacovirus 17499x31_375
  • Spezies Porprismacovirus porci3 (früher Porcine associated porprismacovirus 3) mit Porcine stool-associated circular virus 3
  • Spezies Porprismacovirus porci4 (früher Porcine associated porprismacovirus 4) mit Porcine stool-associated circular virus 1 DP2
  • Spezies Porprismacovirus porci5 (früher Porcine associated porprismacovirus 5) mit Porcine stool-associated circular virus 1 DP3
  • Spezies Porprismacovirus porci6 (früher Porcine associated porprismacovirus 6) mit Porcine stool-associated circular virus 6
  • Spezies Porprismacovirus porci7 (früher Porcine associated porprismacovirus 7) mit Porcine stool-associated circular virus 7
  • Spezies Porprismacovirus porci8 (früher Porcine associated porprismacovirus 8) mit Porcine stool-associated circular virus 8
  • Spezies Porprismacovirus porci9 (früher Porcine associated porprismacovirus 9) mit Porcine stool-associated circular virus 9
  • Spezies Porprismacovirus ratas1 (früher Rat associated porprismacovirus 1) mit Rat stool-associated circular ssDNA virus
  • Spezies Porprismacovirus sheas1 (früher Sheep associated porprismacovirus 1) mit Sheep faeces associated smacovirus 1
  • Spezies Porprismacovirus sheas2 (früher Sheep associated porprismacovirus 2) mit Sheep faeces associated smacovirus 2
  • Spezies Porprismacovirus sheas3 (früher Sheep associated porprismacovirus 3) mit Sheep faeces associated smacovirus 3
  • Spezies Porprismacovirus strut1 mit Smacoviridae sp. 207Smaco
  • Spezies Porprismacovirus turas1 (früher Turkey associated porprismacovirus 1) mit Turkey stool associated circular ssDNA virus

Literatur

Einzelnachweise

  1. 1 2 3 4 ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. 1 2 Arvind Varsani, Mart Krupovic: ​Smacoviridae: a new family of animal-associated single-stranded DNA viruses. In: Virology Division News, Arch Virol, 163, 2005–2015, 23. März 2018; doi:10.1007/s00705-018-3820-z (englisch).
  3. 1 2 ICTV: Taxonomy Browser.
  4. 1 2 Rafaela S. Fontenele, Cristiano Lacorte, Natalia S. Lamas, Kara Schmidlin, Arvind Varsani, Simone G. Ribeiro: Single Stranded DNA Viruses Associated with Capybara Faeces Sampled in Brazil. In: MDPI Viruses, Band 11, Nr. 8, Special Issue Viromics: Approaches, Advances, and Applications; doi:10.3390/v11080710 (englisch).
  5. 1 2 NCBI: LC386203.
  6. ↑ SIB: Smacoviridae, auf: Expasy ViralZone.
  7. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  8. ↑ NCBI: Papio kindae associated smacovirus (species).
  9. 1 2 Paulina D. Anindita, Michihito Sasaki, Gabriel Gonzalez, Wallaya Phongphaew, Michael Carr, Bernard M. Hang’ombe, Aaron S. Mweene, Kimihito Ito, Yasuko Orba, Hirofumi Sawa: Discovery and genetic characterization of diverse smacoviruses in Zambian non-human primates. In: Nature Sci Rep, Band 9, Nr. 5045, 8. pril 2029; doi:10.1038/s41598-019-41358-z (englisch); mit Korrektur doi:10.1038/s41598-019-44438-2. Siehe insbes. Fig. 1 und Tbl. 1.
  10. ↑ NCBI: Papio cynocephalus associated smacovirus (species).
  11. ↑ NCBI: LC386205.
  12. ↑ NCBI: Capybara associated smacovirus 1_cap1_104.
  13. 1 2 O. Blinkova, J. Victoria, Y. Li, B. F. Keele, C. Sanz, J. B. Ndjango, M. Peeters, D. Travis, E. V. Lonsdorf, M. L. Wilson, A. E. Pusey, B. H. Hahn, E. L. Delwart: Novel circular DNA viruses in stool samples of wild-living chimpanzees. In: J. Gen. Virol. 91. Jahrgang, Nr. 1, 2010, S. 74–86, doi:10.1099/vir.0.015446-0, PMID 19759238, PMC 2887567 (freier Volltext) – (englisch).
  14. 1 2 NCBI: Chimpanzee stool associated circular ssDNA virus (species).
  15. ↑ H. K. Kim, S. J. Park, V. G. Nguyen, D. S. Song, H. J. Moon, B. K. Kang, B. K. Park: Identification of a novel single stranded circular DNA virus from bovine stool. In: J Gen Virol, 1. März 2012; doi:10.1099/vir.0.037838-0 (englisch).
  16. ↑ NCBI: Porcine stool-associated circular virus (species).