Der Cystin-Knoten (engl. cystine knot) ist eine Proteinstruktur, die aus drei Disulfidbrücken gebildet wird (d. h. aus drei Paaren von Cystein-Aminosäureresten).
Die Polypeptidkette zwischen zwei dieser Disulfidbrücken bildet einen Ring, durch den die dritte Disulfidbrücke führt (sogenannte Rotaxan-Struktur). Cystin-Knoten kommen in vielen Proteinen vor und stabilisieren die Tertiärstruktur des Proteins. Es werden drei verschiedene Typen von Cystin-Knoten unterschieden, die sich in der Topologie der Disulfidbrücken unterscheiden:
Der Wachstumsfaktor-Cystin-Knoten (GFCK) wurde erstmals in der Struktur des Nervenwachstumsfaktors beschrieben, die 1991 durch Kristallstrukturanalyse von Tom Blundell bestimmt wurde. Alle bisher bekannten GFCK-Strukturen sind dimer, aber sie unterscheiden sich in der Art und Weise der Dimerisierung.