Hendrixvirinae

Hendrixvirinae
TEM-Aufnahme eines Virions von Byrnievirus HK97
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Duplodnaviria Reich: Heunggongvirae Phylum: Uroviricota Klasse: Caudoviricetes ohne Rang: „λ supergroup“ Familie: incertae sedis Unterfamilie: Hendrixvirinae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear Baltimore: Gruppe 1 Symmetrie: ikosaedrisch, tailed (Siphoviren)
Wissenschaftlicher Name
Hendrixvirinae
Links
ICTV Taxon History: 202505557 NCBI Taxonomy: 2842527 ViralZone (Expasy, SIB): 11565 (HK97-fold)

Hendrixvirinae ist die Bezeichnung für eine Unterfamilie von Viren der (Klasse Caudo­viricetes), die Bakterien verschiedener Arten (Spezies) infizieren. Bakterielle Viren werden generell auch Bakteriophagen genannt. Als Mitglieder der Klasse Caudoviricetes haben die Hendrixvirinae einen Kopf-Schwanz-Aufbau, d. h. sie bestehen aus einem Kopf (dem eigentlichen ikosaedrischen Kapsid) und einem „Schwanz“, verbunden durch ein Verbindungsteil („Connector“). Am Ende des Schwanzes befinden sich sog. „Schwanzfasern“.

Forschungsgeschichte

Eine umfassende Studie von Julianne Grose und Sherwood Casjens hatte bereits 2014 gezeigt, dass sich das Genom des Escherichia-Phagen Lambda von dem von HK022 und HK97 unterscheidet.

Die Unterfamilie wurde 2018 vom International Committee on Taxonomy of Viruses mit der Master Species List (MSL) #32 eingerichtet. Sie entstand aus eine Beförderung der früheren Gattung Hendrixvirus (ursprünglich HK97virus) zur Unterfamilie. Das anfangs namensgebende Virus HK97 wurde damit in die neue Gattung Byrnievirus gestellt.

Byrnievirus HK97

Nach Escherichia-Phage HK97 (Spezies Byrnievirus HK97) ist die Faltung der Kapsidproteine im Realm Duplodnaviria benannt, die ikosaedrische Kapside (bzw. Partikelköpfe) mit Triangulationszahlen T=1, 3, 4 oder 16 bilden.

Wanchaivirus HK106

Escherichia-Phage HK106 (Spezies Wanchaivirus HK106) den etwas kleineren Satelliten EcCIEDL933. Diese kodiert alle Proteine, inklusive des kleinen Kapsids (d. h. seines Kopfs), er benötigt von seinem Helfervirus HK106 lediglich das Schwanzteil. Diese Art von Satelliten wird auch englisch phage-inducible chromosomal islands (PICIs) genannt.

Systematik

Die folgende Systematik nach ICTV, Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI) und Actinobacteriophage Database (PhagesDB) umfasst alle Gattungen und in der Regel auch alle bestätigten Spezies (Stand 20. März 2026 – MSL #41v1):

Unterfamilie Hendrixvirinae (früher Gattung Hendrixvirus alias Hk97virus, HK97-ähnliche Viren – s. l., englisch HK97-like group), isometrisches Kapsid, abgetrennt von Lambdavirus

• Gattung Byrnievirus
  • Spezies Byrnievirus HK97 (Escherichia-Virus HK97), mit Escherichia-Phage HK97 alias Enterobacteria-Phage HK97
• Gattung Cuauhtlivirus
  • Spezies Cuauhtlivirus mEpX1 (Escherichia-Virus mEpX1), mit Escherichia-Phage mEpX1
• Gattung Kwaitsingvirus
  • Spezies Kwaitsingvirus HK446 (Escherichia-Virus HK446), mit Escherichia-Phage HK446
  • Spezies Kwaitsingvirus HK544 (Escherichia-Virus HK544), mit Escherichia-Phage HK544
• Gattung Nochtlivirus
  • Spezies Nochtlivirus mEp235, mit Enterobacteria-Phage mEp235
• Gattung Saikungvirus
  • Spezies Saikungvirus HK75 (Escherichia-Virus HK75), mit Escherichia-Phage HK75 alias Enterobacteria-Phage HK75
  • Spezies Saikungvirus HK633 (Escherichia-Virus HK633), mit Escherichia-Phage HK633
• Gattung Shamshuipovirus
  • Spezies Shamshuipovirus HK022 (Escherichia-Virus HK022), mit Escherichia-Phage HK022 alias Enterobacteria-Phage HK022
  • Spezies Shamshuipovirus mEpX2 (Escherichia-Virus mEpX2), mit Escherichia-Phage mEpX2 alias Enterobacteria-Phage mEpX2

• ​Gattung Wanchaivirus (2 Spezies)
  • Spezies Wanchaivirus HK106 (Escherichia-Virus HK106), mit Escherichia-Phage HK106 (hat Satellit EcCIEDL933)
  • Spezies Wanchaivirus mEp234 (Escherichia-Virus mEp234), mit Escherichia-Phage mEp234
• Gattung Wongtaivirus
  • Spezies Wongtaivirus ECP1, mit Escherichia-Phage ECP1
  • Spezies Wongtaivirus HK542, mit Escherichia-Phage HK542
• Gattung Yautsimvirus
  • Spezies Yautsimvirus HK140, mit Enterobacteria-Phage HK140

• Gattung nicht zugewiesen (Vorschläge nach NCBI)
  • Spezies „Aeromonas phage AsXd-1“
  • Spezies „Cronobacter phage ENT39118“
  • Spezies „Enterobacter phage LAU1“
  • Spezies „Enterobacteria phage mEp390“
  • Spezies „Escherichia phage Fraca“
  • Spezies „Morganella phage IME1369_02“
  • Spezies „Proteus phage vB_PvuS_Pm34“
  • Spezies „Providencia phage PSTRCR_117lys“
  • Spezies „Serratia phage vB_SspS_OS31“
  • Spezies „Vibrio phage vB_PvuS_Pm34“

Namensherkunft

Die Unterfamilie (wie die frühere Gattung) ist benannt zu Ehren des amerikanischen Biologen und angesehenen Professors an der Universität Pittsburgh, Roger W. Hendrix (1943–2017), der sich intensiv mit diesen Viren bzw. dem Virus HK97 auseinandersetzte. Er verstarb am 16. August 2017.

Anmerkungen

1. ↑ Ein Hauptproblem bei der Taxonomie dieser Viren ist ihre hohe Rekombinationsfähigkeit.

Weblinks

• Roger W. Hendrix: Dr. Roger Hendrix's Publications

Weiterführende Literatur

• Robert J. Juhala, Michael E. Ford, Robert L. Duda, Anthony Youlton, Graham F. Hatfull, Roger W. Hendrix: Genomic sequences of bacteriophages HK97 and HK022: pervasive genetic mosaicism in the lambdoid bacteriophages. In: Journal of Molecular Biology (jmb), Band 299, Nr. 1, 26. Mai 2000, S. 27-51; doi:10.1006/jmbi.2000.3729, PMID 10860721 (englisch).

Einzelnachweise

1. 1 2 3 4 Andrew M. Kropinski, Jens H. Kuhn, Evelien M. Adriaenssens, Dominik Refardt: To create a new genus, Hk97virus containing two (2) existing and nine (9) new species within the family Siphoviridae. ICTV Approved Proposals: 2017.008B.A.v1.Hk97virus.zip (docx,xlsx), 8. Juni 2017.
2. ↑ Julianne H. Grose, Sherwood R. Casjens: Understanding the enormous diversity of bacteriophages: The tailed phages that infect the bacterial family Enterobacteriaceae. In: Virology, Band 468-470, November 2014, S. 421-443; doi:10.1016/j.virol.2014.08.024 (englisch).
3. ↑ ICTV Taxon Details: Subfamily: Hendrixvirinae .
4. 1 2 3 NCBI Taxonomy: Hendrixvirinae.
5. ↑ S. M. Lehman, M. A. Petit, J. Lossouarn, Y. Tong, I. Tolstoy, Evelien M. Adriaenssens: Promote the genus Hendrixvirus to the rank of subfamily (Hendrixvirinae) and establish nine new genera (Caudovirales: Siphoviridae). ICTV Approved Proposals: 2020.070B.R.Hendrixvirinae.zip (docx,xlsx,pdf), 8. Juni 2017.
6. 1 2 Jumpei Uchiyama, David Prangishvili, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens, Turner, Mart Krupovic, Andrea Moreno Switt et al.: To rename 137 phage genera; and 6 species. ICTV Approved Proposals: 2018.007B.A.v4.rename137gen6sp.zip (docx,xlsx,…), April–Juni 2018.
7. ↑ SIB: HK97 fold. Auf: ViralZone.
8. 1 2 Charlotte Helgstrand, William R. Wikoff, Robert L. Duda, Roger W. Hendrix, John E. Johnson, Lars Liljas: The Refined Structure of a Protein Catenane: The HK97 Bacteriophage Capsid at 3.44 Å Resolution. In: Journal of Molecular Biology (jmb), Band 334, Nr. 5, 12. Dezember 2003, S. 885–899; doi:10.1016/j.jmb.2003.09.035, PMID 14643655 (englisch). Dazu:
   • 1OHG – Structure of the dsDNA Bacteriophage HK97 mature empty capsid – Organism(s): Byrnievirus HK97; doi:10.2210/pdb1OHG/pdb.
9. 1 2 Nasser Alqurainy, Laura Miguel-Romero, Jorge Moura de Sousa, John Chen, Eduardo P. C. Rocha, Alfred Fillol-Salom, José R. Penadés: A widespread family of phage-inducible chromosomal islands only steals bacteriophage tails to spread in nature. In: Cell Host & Microbe, Band 31, Nr. 1, S. 69-82.e5, 11. Januar 2023; doi:10.1016/j.chom.2022.12.001, ResearchGate:366814015, Epub: 2. Januar 2023 (englisch).
10. 1 2 Tagide N. deCarvalho, Elia Mascolo, Steven M. Caruso, Júlia López-Pérez, Kathleen Weston-Hafer, Christopher Shaffer, Ivan Erill: Simultaneous entry as an adaptation to virulence in a novel satellite-helper system infecting Streptomyces species. In: Nature: The ISME Journal, 31. Oktober 2023; doi:10.1038/s41396-023-01548-0 (englisch). Dazu:
    • Claudia Krapp: Erstmals Verbindung zweier Viren beobachtet: Neuer Kooperationsmechanismus zwischen unterschiedlichen Viren entdeckt. Auf: scinexx.de vom 8. November 2023.
    • Ivan Erill: Vampire viruses prey on other viruses to replicate themselves – and ma​y hold the key to new antiviral therapies. Auf: The Conversation vom 3. November 2023.
    • Scientists Shocked by First-Ever Observation of a Virus Latching Onto Another – “I Can’t Believe This”. Auf: SciTechDaily vom 13. November 2023.
    • Viral Vampires: How Predatory Viruses Unlock Secrets to New Antiviral Treatments. Auf: SciTechDaily vom 23. November 2023.
    • Mike McRae: Bizarre First: Viruses Seen 'Biting' Onto Other Viruses Like Tiny Vampires. Auf: science^alert vom 7. November 2023.
11. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
12. ↑ ICTV: Virus Metadata Re​source (VMR).
13. ↑ Preeti Gipson, Matthew L. Baker, Desislava Raytcheva, Cameron Haase-Pettingell, Jacqueline Piret, Jonathan A. King, Wah Chiu: Protruding knob-like proteins violate local symmetries in an icosahedral marine virus. In: Nature Communications. 5. Jahrgang, Nr. 4278, 2. Juli 2014, doi:10.1038/ncomms5278 (englisch). , Corrigendum in: Nature Communications, Band 6, Nr. 6040, 12. Januar 2015, doi:10.1038/ncomms7040.
14. ↑ Sofia Medvedeva, Jiarui Sun, Natalya Yutin, Eugene V. Koonin, Takuro Nunoura, Christian Rinke, Mart Krupovic: Three families of Asgard archaeal viruses identified in metagenome-assembled genomes. In: Nature Microbiology. Band 7, S. 962–973962–973, 27. Juni 2022, doi:10.1038/s41564-022-01144-6, PMID 35760839, ResearchGate:361577803. Dazu:
    • Viruses of Asgard archaea. Preprint auf: CSH bioRχiv, 30. Juli 2021; doi:10.1101/2021.07.29.453957.
15. ↑ Roger Hendrix. pitt.edu, abgerufen am 13. Mai 2017 (englisch). 
16. ↑ The Thinkers. post-gazette.com, 6. April 2009, abgerufen am 13. Mai 2017 (englisch). 
17. 1 2 Obituary: Roger W. Hendrix / Lover of molecular biology and Renaissance music. In: Pittsburgh Post-Gazette. 5. September 2017; abgerufen im 1. Januar 1 (englisch).