Hissar ist die häufigste Umschrift der tadschikisch-persischen geographischen Bezeichnung „ҳисор“, die von dem arabisch-türkischen Wort hisar (arabischحصار, DMGḥiṣār) stammt und dort „Festung“ bedeutet. Alternative Umschriften sind Hissor und Gissar („Gissartal“, „Gissargebirge“), letzteres ist aus der gleichklingenden russischen Umschrift „гиссар“ übertragen.