Manfred Denker (* 20. Juni 1944 in Breslau) ist ein deutscher Mathematiker.
Denker studierte in Erlangen und an der University of Warwick und wurde 1972 an der Universität Erlangen-Nürnberg bei Konrad Jacobs promoviert (Untersuchungen über eine spezielle Klasse von Zerlegungen eines kompakten metrischen Raumes). 1974 habilitierte er sich und wurde Professor an der Universität Göttingen, an der er über jahrelang im Wechsel mit anderen geschäftsführender Direktor des Instituts für Mathematische Stochastik war und 2004 in den Ruhestand ging, und lehrt an der Pennsylvania State University. In Göttingen war er maßgeblich an der Gründung des Interdisziplinären Zentrums für Statistik beteiligt und der Einrichtung des Promotionsstudiengangs Angewandte Statistik und Empirische Methoden. 1977/78 und 2000/2001 war er Dekan der Mathematischen Fakultät.
Denker befasst sich mit Wahrscheinlichkeitstheorie, stochastischen Prozessen, komplexer Dynamik, Fraktaler Geometrie, Ergodentheorie, nichtparametrischer Statistik und dem thermodynamischen Formalismus in der Theorie dynamischer Systeme.
Zu seinen Doktoranden gehören die Professoren Hajo Holzmann (Marburg), Herold Dehling (Groningen, Bochum), Axel Munk (Göttingen), Marc Keßeböhmer (Bremen), Ansgar Steland (Aachen), Uwe Rösler (Kiel). Er war zu längeren Forschungsaufenthalten in den USA, Japan, Frankreich, Israel und Polen.
2003 wurde er Herausgeber des Journals „Stochastics and Dynamics“.