Markgraben, Oberlauf der Großen Gaißach unterm Luckenkopf an der Gemeindegrenze von Gaißach, Landkreis Bad Tölz-Wolfratshausen, zu Waakirchen, Landkreises Miesbach
Markgraben (Gütlegraben), linker Oberlauf des Gütlegrabens (zum Kankerbach) bis vor Plattele, Gemeinde Krün entlang der Gemeindegrenze zu Garmisch-Partenkirchen, beide Landkreis Garmisch-Partenkirchen, welcher in den mündet
Markgraben (Obernachkanal), rechter Zufluss des Obernachkanals oberhalb von Einsiedel, Gemeinde Jachenau, Landkreis Bad Tölz-Wolfratshausen
Markgraben (Ölsnitz), linker Zufluss der Ölsnitz nahe der Pfarrschneidmühle von Geroldsgrün an der Grenze zwischen dem Geroldsgrüner Forst, Landkreis Hof, und Markt Steinwiesen, Landkreis Kronach, welche in die Rodach (Main) mündet
Markgraben, linker Zufluss der Partnach bei Reinthal, Markt Garmisch-Partenkirchen, Landkreis Garmisch-Partenkirchen
Markgraben (Steinbach, Bichl), linker Zufluss des Steinbachs (zur Loisach bei Bichl) an der Gemeindegrenze von Benediktbeuern zu Bichl, beide Orte im Landkreis Bad Tölz-Wolfratshausen
Markgraben, rechter Zufluss des Sulzbachs bei der Stickelalm von Lenggries, Landkreis Bad Tölz-Wolfratshausen, der gleich darauf in den Hirschbach (Isar) mündet
Markgraben (Weißenbach), linker Zufluss des Weißenbach (Halbammer) entlang der Gemeindegrenze von Wildsteig, Landkreis Weilheim-Schongau, zu Halblech, Landkreis Ostallgäu, welcher der linke Oberlauf der Halbammer ist