1825 kehrte er nach München zurück, ließ sich als freischaffender Künstler nieder und wurde Mitglied und Konservator des Kunstvereins München. Als typischer Vertreter des Biedermeier schuf Neher viele Kostümstücke und Landschaften. Mit seinen Ansichten von öffentlichen Plätzen sowie architektonischen Darstellungen aus vielen bayerischen Städten machte er sich ebenfalls einen Namen.
Im Schloss Hohenschwangau gestaltete Neher den "Saal des Schwanritters" mit Werken im Stil Peter Paul Rubens und den "Heldensaal" nach Moritz von Schwinds Kompositionen. In seinem Spätwerk (ab 1837) verlegte sich Neher fast völlig auf die Architekturmalerei. Die ganze Palette von Meisterwerken deutscher Baukunst gestaltete er liebevoll und er ist wegen seiner Detailgenauigkeit auch heute noch bekannt.
Im Alter von 78 Jahren starb Michael Neher am 4. Dezember 1876 in München.
Die Grabstätte von Michael Neher befindet sich auf dem Alten Südlichen Friedhof in München (Gräberfeld 5 – Reihe 1 – Platz 19, Standort48.12922222222211.566472222222). In dem Grab liegt auch Nehers Tochter Anna (†1891).
Werke
Einige von Hyacinth Holland in der Allgemeinen Deutschen Biographie (ADB) genannte Werke:
Frauen am Brunnen in Olevano, 1826 (Sammlung Schäfer, Schweinfurt)
Brücke in e. dt. Stadt, 1841 (Sammlung Schäfer, Schweinfurt)
Die Stiftskirche zu Wimpfen, 1846 (Sammlung Schäfer, Schweinfurt)
Einsiedelei, 1829 (Kunsthalle Hamburg)
Kirchplatz in Wasserburg am Inn, 1838 (Kunsthalle Hamburg)
Wallfahrtskirche in Altötting, 1837 (Nationalgalerie Berlin)
Das Innere der Trausnitzkapelle in Landshut, 1838,
Das ehemalige Einlaßtor in München, 1842 (Neue Pinakothek München)
Aus Andernach, 1855 (Neue Pinakothek München)
Aus Wasserburg, 1873 (Neue Pinakothek München)
Klosterhof in Kaufbeuren, 1852 (Museum der Bildenden Künste Leipzig)
Die Kathedrale in Tournay, 1856 (Niedersächsische Landesgalerie)
Bilderauswahl
Eine Auswahl von Bildern Michael Nehers mit Ansichten von Städten (weitere in Commons):
Horst Ludwig u. a.: Münchner Maler im 19. Jahrhundert. Bruckmann, München 1982, ISBN 3-7654-1633-9 (Band 1–4)
Münchner Biedermeier, Ausstellungskatalog der Bayerischen Vereinsbank und der Stiftung Schlösser und Gärten Potsdam-Sanssouci im Palais Preysing, München 17. Oktober bis 7. Dezember 1991, Bayerische Vereinsbank (wahrscheinlich nur noch im Antiquariat)
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