Das Museum Flehite ist ein kulturhistorisches Museum in Amersfoort in den Niederlanden. Es widmet sich der Geschichte der Stadt Amersfoort sowie der Region Eemland. Das Museum verfügt über eine Dauerausstellung zur Stadt- und Regionalgeschichte, die einen Zeitraum von mehr als 750 Jahren umfasst. Ergänzend werden regelmäßig Sonderausstellungen zur Kunst- und Kulturgeschichte sowie zu zeitgenössischer Kunst und Fotografie gezeigt.
Das Museum geht auf die 1878 gegründete „Oudheidkundige Vereniging Flehite“ (Archäologische Vereinigung Flehite) zurück. Die eigentliche Museumsgründung erfolgte 1880. 1889 erwarb die Vereinigung ein Gebäude an der Breestraat 78, das fortan als Museumsstandort diente. Weitere angrenzende Gebäude wurden 1958 und 1974 hinzugefügt. Seit 1976 wird das Museum von einer eigenständigen Organisation betrieben. Im Jahr 2007 wurde das Museum wegen Asbestbelastung geschlossen und umfassend modernisiert; die Wiedereröffnung erfolgte im Mai 2009.
Das Museum ist in drei miteinander verbundenen spätmittelalterlichen beziehungsweise frühneuzeitlichen Mauerhäusern untergebracht, die um 1540 errichtet wurden und sich in der historischen Altstadt von Amersfoort befinden. Die Gebäude liegen im Bereich der sogenannten „Muurhuizen“, die entlang der ehemaligen Stadtmauer errichtet wurden.
Nach Angaben des Museums befinden sich über 27.000 Exponate im Bestand, darunter Gemälde, Zeichnungen, Druckgrafiken sowie kunsthandwerkliche und alltagsgeschichtliche Objekte. Die Bestände dokumentieren die Geschichte Amersfoorts von der Vor- und Frühgeschichte bis in die Gegenwart. Zu den Objekten zählen unter anderem archäologische Funde, stadtgeschichtliche Zeugnisse, Kunstwerke lokaler Künstler sowie Gegenstände des täglichen Lebens. Einzelne Exponate stehen exemplarisch für bestimmte historische Ereignisse oder Epochen, darunter Objekte aus der Zeit der französischen Besatzung um 1810 oder Zeugnisse aus dem Zweiten Weltkrieg. Die Sammlung umfasst auch Werke regionaler Künstler wie Mathias Withoos sowie Bestände der sogenannten Amersfoorter Schule des frühen 20. Jahrhunderts.
