Pacearchaeota

Die Pacearchaeen bilden nach phylogenetischen Untersuchungen eine Klade von Archaeen im Reich Nanobdellati (früher DPANN-Supergruppe). Die genaue Taxonomie dieser ursprünglich als DVHE-6-Gruppe (Deep-sea Hydrothermal Vent Euryarchaeota 5 Group, auch DVNEG-6) bezeichneten Klade ist noch in der Diskussion (Stand 2025); sie bilden ja nach Taxonomie entweder ein eigenes Phylum „Ca. Pacearchaeota“, oder eine Kandidaten-Ordnung „Pacearchaeales“ in der Klasse Nanobdellia. Gesichert scheint dagegen ihre Zugehörigkeit zum Reich Nanobdellati (die frühere DPANN-Supergruppe). Auch wenn es bisher nicht möglich war, sie zu kultivieren (Stand Mitte Dezember 2025), so wurde durch genetische Analysen festgestellt, dass sie sich erheblich von anderen Archaeen unterscheiden. Pacearchaeen wurden sowohl in Sedimenten als auch in Oberflächengewässern von Grundwasserleitern und Seen identifiziert; sie kommen besonders unter salzhaltigen Bedingungen zusammen mit den Woesearchaeen (die ebenfalls noch Kandidatenstatus haben) vor. Die Genanalysen zeigten, dass sie kleine Genome und begrenzte Stoffwechselkapazitäten aufweisen. Dennoch lässt die Zusammensetzung ihrer Genome vermuten, dass sie eine wichtige Rolle im Kreislauf von Wasserstoff und Kohlenstoff spielen.

Systematik

Die derzeit akzeptierte Taxonomie basiert auf der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) und dem National Center for Biotechnology Information (NCBI); Ergänzungen nach der Genome Taxonomy Database (GTDB); Auszugsweise Liste (Stand: 17. Dezember 2025):

Phylum „Candidatus Pacearchaeota“ Castelle et al. 2015^(L,N,C) – in der GTDB synonym zu Nanobdellota, in der LPSN verwaist

• Klasse nicht zugewiesen – in der GTDB zu Nanobdellia

• Ordnung Pacearchaeales^(G) – in der GTDB Nanobdellia (Nanobdellota) zugeordnet

• Familie f__CG1-02-31-27^(G)
  • Gattung CG1-02-31-27^(G)
    • Spezies CG1-02-31-27 sp002763115^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_31_59^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_9_14_3_um_filter_31_7^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_10_14_0_2_um_filter_31_10^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG1_02_31_27^(N)]
      • Stamm CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_31_59^(N,G)
      • Stamm CG_4_9_14_3_um_filter_31_7^(N,G)
      • Stamm CG_4_10_14_0_2_um_filter_31_10^(N,G)
      • Stamm CG1_02_31_27^(N,G)

• Familie f__GW2011-AR1^(G)
  • Gattung 1-14-0-10-34-76^(G)
    • Spezies 1-14-0-10-34-76 sp002763075^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_34_76^(N)]
      • Stamm CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_34_76^(N,G)
  • Gattung CG1-02-35-32^(G)
    • Spezies CG1-02-35-32 sp002792635^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_10_14_0_2_um_filter_35_33^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon isolate CG_2015-01t_35_29^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG1_02_35_32^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_35_219^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_9_14_3_um_filter_35_19^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_10_14_0_8_um_filter_35_169^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_9_14_0_8_um_filter_35_24^(N)]
      • Stamm CG_4_10_14_0_2_um_filter_35_33^(N,G)
      • Stamm CG_2015-01t_35_29^(N,G)
      • Stamm CG1_02_35_32^(N,G)
      • Stamm CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_35_219^(N,G)
      • Stamm CG_4_9_14_3_um_filter_35_19^(N,G)
      • Stamm CG_4_10_14_0_8_um_filter_35_169^(N,G)
      • Stamm CG_4_9_14_0_8_um_filter_35_24^(N,G)
  • Gattung CG1-02-39-14^(G)
    • Spezies CG1-02-39-14 sp001872315^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon CG1_02_39_14^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon isolate CG_2015-01t_39_43^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_9_14_0_2_um_filter_39_13^(N)]
      • Stamm CG1_02_39_14^(N,G)
      • Stamm CG_2015-01t_39_43^(N,G)
      • Stamm CG_4_9_14_0_2_um_filter_39_13^(N,G)
    • Spezies EX4484-71^(G)
      • Sppezies EX4484-71 sp002254395^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon ex4484_71^(N)]
        • Stamm ex4484_71^(N,G)
  • Gattung GW2011-AR1^(G)
    • Spezies GW2011-AR1 sp002762735^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon CG11_big_fil_rev_8_21_14_0_20_30_13^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon isolate RIFOXYA1_FULL_30_12^(N), Uncultured archaeon isolate CTOTU11684^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_10_14_0_2_um_filter_30_11^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon isolate CG_2015-01t_30_11^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG1_02_30_18^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_9_14_3_um_filter_30_11^(N), Archaeon GW2011_AR1^(N), Nanoarchaeota archaeon UBA12092^(G)]
      • Stamm CG11_big_fil_rev_8_21_14_0_20_30_13^(N,G)
      • Stamm RIFOXYA1_FULL_30_12^(N,G)
      • Stamm CTOTU11684^(N,G)
      • Stamm CG_4_10_14_0_2_um_filter_30_11^(N,G)
      • Stamm CG_2015-01t_30_11^(N,G)
      • Stamm CG1_02_30_18^(N,G)
      • Stamm CG_4_9_14_3_um_filter_30_11^(N,G)
      • Stamm GW2011_AR1^(N,G) alias AR1^(C) – Fundort: Grundwasserleiter (Aquifer) in der Nähe des Colorado River bei Rifle, Colorado, USA.^(C)
      • Stamm UBA12092^(G)
  • Gattung MFWN01^(G)
    • Spezies MFWN01 sp001786395^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon RBG_13_36_9^(N)]
      • Stamm RBG_13_36_9^(N,G)
  • Gattung MNVX01^(G)
    • Spezies MNVX01 sp001872185^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon CG1_02_32_21^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_10_14_0_2_um_filter_05_32_18^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_31_9^(N)]
      • Stamm CG1_02_32_21^(N,G)
      • Stamm CG_4_10_14_0_2_um_filter_05_32_18^(N,G)
      • Stamm CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_31_9^(N,G)
  • Gattung PFCY01^(G)
    • Spezies PFDC01 sp002763035^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_35_13^(N)]
      • Stamm CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_35_13^(N,G)
    • Spezies PFCY01 sp002763085^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_32_14^(N)]
      • Stamm CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_32_14^(N,G)
  • Gattung RBG-13-33-26^(G)
    • Spezies RBG-13-33-26 sp001786415^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon RBG_19FT_COMBO_34_9^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon RBG_13_33_26^(N)]
      • Stamm RBG_19FT_COMBO_34_9
      • Stamm RBG_13_33_26^(N,G)
  • Gattung UBA73^(G)
    • Spezies UBA73 sp002496015^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon UBA73^(N)]
      • Stamm UBA73^(N,G)
  • Gattung UBA92^(G)
    • Spezies UBA92 sp002497285^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon UBA92^(N), Ca. Pacearchaeota archaeon CG1_02_32_132^(N)]
      • Stamm UBA92^(N,G)
      • Stamm CG1_02_32_132^(N,G)

• Familie f__PEVX01^(G)
  • Gattung PEVX01^(G)
    • Spezies PEVX01 sp002780285^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon CG06_land_8_20_14_3_00_35_12^(N)]
      • Stamm CG06_land_8_20_14_3_00_35_12^(N,G)

• Familie f__UBA284^(G)
  • Gattung DAOWHW01^(G)
    • Spezies DAOWHW01 sp026016245^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon isolate Pace33H^(N)]
      • Stamm Pace33H^(N,G)
  • Gattung EX4484-31^(G)
    • Spezies EX4484-31 sp002254805^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon ex4484_31^(N)]
      • Stamm ex4484_31^(N,G)
  • Gattung UBA284^(G)
    • Spezies UBA284 sp002499185^(G) [Ca. Pacearchaeota archaeon UBA284^(N)]
      • Stamm UBA284^(N,G)

• ohne Ordnungs- bis Gattungs-Zuweisung

• Spezies Ca. Pacearchaeota archaeon CG09_land_8_20_14_0_10_30_9^(N)
  • Stamm CG09_land_8_20_14_0_10_30_9^(N,G)
• Spezies Ca. Pacearchaeota archaeon CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_30_48^(N)
  • Stamm CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_30_48^(N,G)
• Spezies Ca. Pacearchaeota archaeon CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_31_24^(N)
  • Stamm CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_31_24^(N,G)
• Spezies Ca. Pacearchaeota archaeon CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_32_42^(N)
  • Stamm CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_32_42^(N,G)
• Spezies Ca. CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_34_12^(N)
  • Stamm CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_34_12^(N,G)
• Spezies Ca. Pacearchaeota archaeon CG_4_9_14_0_2_um_filter_30_8^(N)
  • Stamm CG_4_9_14_0_2_um_filter_30_8^(N,G)
• Spezies Ca. Pacearchaeota archaeon RBG_16_35_8^(N)
  • Stamm RBG_16_35_8^(N,G)
• Spezies Ca. Pacearchaeota archaeon ex4484_26^(N)
  • Stamm ex4484_26^(N,G)

(L) – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) inkl. BacDive

(N) – Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI)

(G) – Genome Taxonomy Database (GTDB)

(C) – Cindy J. Castelle et al. (2015)

Der erstgenannte Stamm (eigentlich: das MAG) ist jeweils die Referenz. Die Zugehörigkeit des ersten sequenzierten Stamms, GW2011_AR1 wurde fett wiedergegeben.

Etymologie

Mit der Bezeichnung der Pacearchaeen wird Professor Norman R. Pace für seine Beiträge zur Phylogenie der Archaeen und zu kultivierungsunabhängigen phylogenetischen Analysen geehrt. Die Endungen ‚-archaeota‘ bzw. ‚-archaeales‘ kennzeichnen Archaeen-Phyla respektive -Ordnungen.

Weiterführende Literatur

• Mateu Menéndez Serra, Vicente J. Ontiveros, Xavier Triadó-Margarit, David Alonso, Emilio O Casamayor: Dynamics and ecological distributions of the Archaea microbiome from inland saline lakes (Monegros Desert, Spain). In: FEMS Microbiology Ecology, Band 96, Nr. 3, 1. Februar 2020, S. fiaa019; doi:10.1093/femsec/fiaa019, ResearchGate:338986799 (englisch).

Einzelnachweise

1. 1 2 3 4 LPSN: Phylum "Candidatus Pacearchaeota" Castelle et al. 2015.
2. 1 2 3 4 5 Cindy J. Castelle, Kelly C. Wrighton, Brian C. Thomas, Laura A. Hug, Christopher T. Brown, Michael J. Wilkins, Kyle R. Frischkorn, Susannah G. Tringe, Andrea Singh, Lye Meng Markillie, Ronald C. Taylor, Kenneth H. Williams, Jillian F. Banfield: Genomic Expansion of Domain Archaea Highlights Roles for Organisms from New Phyla in Anaerobic Carbon Cycling. In: Current Biology. 25. Jahrgang, Nr. 6, 16. März 2015, ISSN 0960-9822, S. 690–701, doi:10.1016/j.cub.2015.01.014 (englisch). 
   Anm.: Die in der Studie mit AR-Nummern bezeichneten Stämme tragen in der GTDB und der NCBI-Taxonomie den Präfix ‚GW2011_‘ (z. B. GW2011_AR15), die zugehörigen Taxa in der GTDB den Präfix ‚GW2011-‘ (z. B. GW2011-AR15).
3. 1 2 3 4 GTDB: Nanobdellota. Dazu:
   • Pacearchaeales.
4. ↑ Christian Rinke, Maria Chuvochina, Aaron J. Mussig, Pierre-Alain Chaumeil, Adrián A. Davín, David W. Waite, William B. Whitman, Donovan H. Parks, Philip Hugenholtz: A standardized archaeal taxonomy for the Genome Taxonomy Database. In: Nature Microbiology, Band 6, 21. Juni 2021, S. 946–959; doi:10.1038/s41564-021-00918-8 (englisch).
5. 1 2 3 NCBI Taxonomy Browswer: Candidatus Pacearchaeota. Details: "Candidatus Pacearchaeota" Castelle et al. 2015. Rank: phylum. Graphisch: Candidatus Pacearchaeota. Auf: Lifemap. Dazu:
   • NCBI Nucleotide: GW2011_AR*.
6. ↑ Rudiger Ortiz-Alvarez, Emilio O. Casamayor: High occurrence of Pacearchaeota and Woesearchaeota (Archaea superphylum DPANN) in the surface waters of oligotrophic high‐altitude lakes. In: Environmental Microbiology Reports. 8. Jahrgang, Nr. 2, April 2016, ISSN 1758-2229, ResearchGate:288701274, Epub 28. Dezember 2015, S. 210–217, doi:10.1111/1758-2229.12370, PMID 26711582 (englisch).