Ein Reliktsee ist der Rest eines früheren Meeres, der entweder durch eine Absenkung des Meeresspiegels oder durch eine Landhebung von diesem getrennt wurde.
Der Begriff schließt auch einstige Binnengewässer ein, also Flüsse, Süßwasser-Seen, die durch tektonische Veränderungen austrockneten und oft noch geologisch nachweisbare Spuren hinterließen.
Ein bekanntes Beispiel ist das Kaspische Meer, der größte See der Welt.