STR-Analyse

Die STR-Analyse ist eine Methode der DNA-Analyse zur Bestimmung von Short Tandem Repeats. Ihr Anwendungsgebiet findet die STR-Methode als STR-Profilanalyse in der Kriminalistik, der Rechtsmedizin und bei Vaterschaftsnachweisen. Zudem wird diese Methode in der biomedizinischen Forschung zur Authentifizierung von humanen (Mensch) und murinen (Maus) Zelllinien eingesetzt.

Eigenschaften

Bei der STR-Analyse wird die Anzahl an short tandem repeats auf mehreren Chromosomen durch eine DNA-Extraktion mit einer anschließenden Polymerase-Kettenreaktion (PCR) bestimmt. STR sind Mikrosatelliten mit einer Länge zwischen zwei und dreizehn Nukleotiden, die im Genom hundertfach in Serie auf jedem Chromosom vorkommen. Bei einem Abstammungsgutachten per STR-Analyse werden zwei verschiedene Proben verglichen. Nach der PCR werden die Amplifikate meistens per Agarose-Gelelektrophorese oder Kapillarelektrophorese getrennt und nachgewiesen. Eine Analyse mittels Mikrofluidik-basierter Systeme ist in bestimmten Fällen ebenfalls möglich. Eine STR-Analyse kann auch ohne DNA-Extraktion durchgeführt werden. In der biomedizinischen Forschung können zur Authentifizierung von etablierten Zelllinien selbstgenerierte STR-Profile mit Datenbanken, wie z. B. CLASTR oder STRBase abgeglichen werden.

Einzelnachweise

  1. 1 2 Yingfen Hong, Nikita Singh, Stefanos Bamopoulos, Enio Gjerga, Laura K. Schmalbrock: Authentication of Primary Murine Cell Lines by a Microfluidics-Based Lab-On-Chip System. In: Biomedicines. Band 8, Nr. 12, 9. Dezember 2020, ISSN 2227-9059, doi:10.3390/biomedicines8120590, PMID 33317212, PMC 7763653 (freier Volltext).
  2. ↑ A. Ambers, H. Gill-King, D. Dirkmaat, R. Benjamin, J. King, B. Budowle: Autosomal and Y-STR analysis of degraded DNA from the 120-year-old skeletal remains of Ezekiel Harper. In: Forensic science international. Genetics. Band 9, März 2014, S. 33–41, ISSN 1878-0326. doi:10.1016/j.fsigen.2013.10.014. PMID 24528577.
  3. ↑ C. Hohoff, B. Brinkmann: Human identity testing with PCR-based systems. In: Molecular biotechnology. Band 13, Nummer 2, Dezember 1999, S. 123–136, ISSN 1073-6085. doi:10.1385/MB:13:2:123. PMID 10934527.
  4. ↑ J. M. Butler, E. Buel, F. Crivellente, B. R. McCord: Forensic DNA typing by capillary electrophoresis using the ABI Prism 310 and 3100 genetic analyzers for STR analysis. In: Electrophoresis. Band 25, Nummer 10–11, Juni 2004, S. 1397–1412, ISSN 0173-0835. doi:10.1002/elps.200305822. PMID 15188225.
  5. ↑ J. E. Sim, S. J. Park, H. C. Lee, S. Y. Kim, J. Y. Kim, S. H. Lee: High-throughput STR analysis for DNA database using direct PCR. In: Journal of forensic sciences. Band 58, Nummer 4, Juli 2013, S. 989–992, ISSN 1556-4029. doi:10.1111/1556-4029.12166. PMID 23683293.
  6. ↑ CLASTR 1.4.4, auf web.expasy.org
  7. ↑ Short Tandem Repeat DNA Internet DataBase, auf strbase.nist.gov