Werlen studierte Rechtswissenschaften an der Universität Zürich, wo er zum Dr. iur. promovierte. Anschliessend erwarb er den LL.M. an der Harvard Law School. Er habilitierte sich an der Universität St. Gallen im Bereich Finanz- und Kapitalmarktrecht.
Nach Tätigkeiten in New York und London bei den Kanzleien Cravath, Swaine & Moore und Davis Polk & Wardwell war Werlen Partner bei Allen & Overy in London mit Schwerpunkt auf Kapitalmarkt-, Derivate- und M&A-Transaktionen.
Von 2006 bis 2011 war er Group General Counsel und Mitglied des Executive Committee bei Novartis. Seit 2012 ist er als Managing Partner bei Quinn Emanuel Urquhart & Sullivan tätig und eröffnete 2016 das Büro in Zürich.
Tätigkeit
2010 war er als General Counsel federführend bei der dannzumalig grössten Übernahme einer Firma in der Schweiz, als Novartis die Augenbehandlungsfirma Alcon für 40 Milliarden CHF kaufte. Die Bilanz bezeichnete ihn 2020 als «Anwalt, der Schweizer Konzerne das Fürchten lehrt». Mehrmals tauchte sein Name in grossen Wirtschaftsfällen auf. Werlen berät Unternehmen, Finanzinstitute und Einzelpersonen in internationalen Wirtschafts- und Finanzstreitigkeiten, White-Collar-Verfahren und Rechtsstreitigkeiten in der Schweiz aber auch im Ausland. Zu seinen Mandaten zählten unter anderem komplexe Auseinandersetzungen im Zusammenhang mit der Übernahme der Credit Suisse durch die UBS und der Abschreibung von AT1-Anleihen aber auch die Arbeit im Spygate-Skandal. In einem ersten Schritt gelang dem Team um Thomas Werlen im AT1-Streit ein entscheidender Erfolg vor dem Bundesverwaltungsgericht. Dieses gab ihm im Oktober 2025 in einem Teilentscheid in allen Punkten vollumfänglich Recht; die FINMA und die UBS haben den Entscheid ans Bundesgericht weitergezogen.
Im Spygate-Skandal konnte Thomas Werlen einen Sieg gegen die Kanzlei Homburger erringen und war für das Enforcement-Verfahren der FINMA zentral. Zuvor war er auch für die FIFA tätig und dort für den Fussballverband gegen den angeklagten Sepp Blatter im Dienst.
In der Handelszeitung und der Bilanz wurde Werlen als einer der profiliertesten Wirtschaftsanwälte der Schweiz bezeichnet.
Publikationen
Mit Sulzer Stefan: Aspekte der US–amerikanischen Securities Laws. In: Habersack/Mülbert/Schlitt: Unternehmensfinanzierung am Kapitalmarkt. 5. Auflage, Frankfurt 2025.
Mit Thomas U. Reutter: Aktuelle Fragen zum schweizerischen und internationalen Kapitalmarktrecht. Zürich 2023.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkt – Recht und Transaktionen XVIII. Zürich 2022.
Mit Reto Arpagaus, Ralph Stadler: Das Schweizerische Bankgeschäft. 8. Aufl. Zürich 2021 (neben der Arbeit als Herausgeber auch Alleinautor von Teil 1 Einführung und Teil 6 Investmentbanking und Handel).
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkt – Recht und Transaktionen XVI. Zürich 2021.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkt – Recht und Transaktionen XV. Zürich 2020.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkt – Recht und Transaktionen XIV. Zürich 2019.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkt – Recht und Transaktionen XIII. Zürich 2019.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkt – Recht und Transaktionen XII. Zürich 2018.
Mit William Johnston: Set-Off Law and Practice – An International Handbook. 3rd Edition, Oxford 2018.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkt – Recht und Transaktionen XII. Zürich 2017.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkt – Recht und Transaktionen XI. Zürich 2016.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkttransaktionen X. Zürich 2015.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkttransaktionen IX. Zürich 2014.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkttransaktionen VIII. Zürich 2013.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkttransaktionen VII. Zürich 2012.
Mit Urs Emch, Hugo Renz, Reto Arpagaus: Das Schweizerische Bankgeschäft. 7. Aufl., Zürich 2012, Alleinautor von Teil 5 Investmentbanking und Handel (Kapitalmarktrecht (Primär- und Sekundärmarkt sowie Derivatgeschäfte) (mit Ausnahme der Unterabschnitte V- VIII).
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkttransaktionen VI. Zürich 2011.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkttransaktionen V. Zürich 2010.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkttransaktionen IV. Zürich 2009.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkttransaktionen III. Zürich 2008.
Mit Thomas U. Reutter: Kapitalmarkttransaktionen II. Zürich 2007.
Mit Thomas U. Reutter, Rolf Watter: Kapitalmarkttransaktionen. Zürich 2006.
Regulierung der derivativen Instrumente in den USA (Stand der Diskussion und Entwicklungstendenzen). In: Weber/Hirszowicz: Derivative Finanzinstrumente und Eigenmittelvorschriften. Zürich 1995.
Dieter Zobl: 1992 ISDA Master Agreement, unter besonderer Berücksichtigung der Swapgeschäfte. Zürich 1995.
Dieter Zobl: Rechtsprobleme des bilateralen Netting. Zürich 1994.
Konzeptionelle Grundlagen des schweizerischen Kapitalmarktrechts. Diss. Zürich. Zürich 1994 (= Schweizerische Schriften zum Bankenrecht. 23).
