Wirthbacteria

Wirthbakterien
Systematik
Domäne: Bakterien (Bacteria)
Reich: Terrabakterien (Bacillati)
Stamm: Minisyncoccota (CPR-Gruppe) / „Ca. Wirthibacterota“
Klasse: Wirthbakterien
Wissenschaftlicher Name
„Wirthibacteria“

„Ca. Wirthbacteria“ (GTDB: c__CG2-30-54-11) ist eine ursprünglich als Phylum (Abteilung) vorgeschlagene Klasse von Bakterien. Sie wurde – wie 2017 beschrieben – erstmals in einer Stichprobe aus dem Aquifer des Kaltwassergeysirs Crystal Geyser entdeckt (Spezies „Wirthibacter wanneri“). Diese Bakterien stehen in einer basalen Position zur CPR-Gruppe (Candidate Phyla Radiation, heute Phylum Minisyncoccota – in der GTDB „Patescibacteriota“). Ihre Zugehörigkeit zu dieser Gruppe wird diskutiert. In der GTDB gilt die Klasse als Mitglied, die Taxonomien der LPSN und des NCBI führen sie als eigenständiges Phylum „Candidatus Wirthibacterota“ (bzw. veraltet „Ca. Wirthibacteria“, sic!).

Die Withbakterien wurden durch Genomanalyse identifiziert und konnten bisher noch nicht kultiviert werden, haben daher Kandidatenstatus (Stand 1. März 2026). Sie weisen einige Merkmale wie die Mitglieder der CPR-Gruppe (Minisyncoccota) auf wie z. B. geringe Größe, fehlende Atmungsketten, reduzierter Stoffwechsel, niedrige Nukleotid- und Aminosäuresynthese usw., und stehen dieser Gruppe daher zumindest nahe. Die letzten drei genannten Merkmale erschweren die Kultivierung dieser Bakterien.

Systematik

Systematik der Withbakterien mit Stand 1. März 2026:

Klasse „Ca. Wirthbacteria“(G°) [c__CG2-30-54-11(G)] – früher Phylum „Ca. Wirthibacterota“ corrig. Hug et al. 2016 [„Ca. Wirthbacteria“ Hug et al. 2016](L°,N)


Etymologie

Die Bezeichnungen der höheren Taxa beziehen sich auf die Typusgattung „Ca. Wirthibacter“, die nach Prof. Reinhold Wirth von der Universität Regensburg benannt wurde, um seine Verdienste zur Erforschung der Chemoautotrophen und das Schwimmverhalten (als Fortbewegungsmethode) dieser Prokaryoten.

Einzelnachweise

  1. 1 2 Alexander J. Probst, Cindy J. Castelle, Andrea Singh, Christopher T. Brown, Karthik Anantharaman, Itai Sharon, Laura A. Hug, David Burstein, Joanne B. Emerson, Brian C. Thomas, Jillian F. Banfield: Genomic resolution of a cold subsurface aquifer community provides metabolic insights for novel microbes adapted to high CO2 concentrations. In: Environmental Microbiology, Band 19, Nr. 2, Februar 2017, S. 459–474; doi:10.1111/1462-2920.13362, PMID 27112493, eScholarship:400782gj, Epub 26. April 2016 (englisch).
  2. 1 2 GTDB: c__CG2-30-54-11.
  3. ↑ Mohamad Maatouk, Jean-Marc Rolain, Fadi Bittar: Using Genomics to Decipher the Enigmatic Properties and Survival Adaptation of Candidate Phyla Radiation. In: MDPI: Microorganisms, Band 11, Nr. 5, Special Issue New Methods in Microbial Research 3.0, 7. Mai 2023, S. 1231; doi:10.3390/microorganisms11051231 (englisch).
  4. 1 2 3 4 LPSN: Name: "Candidatus Wirthibacterota" corrig. Hug et al. 2016.
    "Candidatus Wirthbacteria" Hug et al. 2016.
  5. 1 2 NCBI Taxonomy Browser: Candidatus Wirthbacteria. Details: Candidatus Wirthbacteria. Rank: phylum.
  6. 1 2 Laura A. Hug, Brett J. Baker, Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, Alexander J. Probst, Cindy J. Castelle, Cristina N. Butterfield, Alex W. Hernsdorf, Yuki Amano, Kotaro Ise, Yohey Suzuki, Natasha Dudek, David A. Relman, Kari M. Finstad, Ronald Amundson, Brian C. Thomas, Jillian F. Banfield: A new view of the tree of life. In: Nature Microbiology. Band 16048. Jahrgang, Nr. 5, April 2016, ResearchGate:301271772, S. 16048, doi:10.1038/nmicrobiol.2016.48, PMID 27572647 (englisch).
  7. ↑ Benjamin J. Tully, Rohan Sachdeva, Elaina D. Graham, John F. Heidelberg: 290 Metagenome-assembled Genomes from the Mediterranean Sea: a re​source for marine microbiology. In: PeerJ, Band 5, 10. Juli 2017, S. e3558; doi:10.7717/peerj.3558, PMC 5507172 (freier Volltext), PMID 28713657 (englisch). Dazu:
  8. ↑ Charlotte D. Vavourakis, Adrian-Stefan Andrei, Maliheh Mehrshad, Rohit Ghai, Dimitry Y. Sorokin, Gerard Muyzer: A metagenomics roadmap to the uncultured genome diversity in hypersaline soda lake sediments. In: Springer: Microbiome, Band 6, Nr. 168, 19. September 2018; doi:10.1186/s40168-018-0548-7 (englisch).
  9. ↑ LPSN: Search taxonomy.
  10. ↑ Genome Taxonomy Database (GTDB) Release 09-RS220
  11. ↑ Vitaly V. Kadnikov, Andrey V. Mardanov, Alexey V. Beletsky, Olga V. Karnachuk, Nikolai V. Ravin: Microbial Life in the Deep Subsurface Aquifer Illuminated by Metagenomics. In: Frontiers in Microbiology, Sec. Extreme Microbiology, Band 11, 3. September 2020; doi:10.3389/fmicb.2020.572252 (englisch). Siehe insbes. Supplementary Table S1.