Su obra más conocida, y la más influyente de todo el sigloXX, es la que estableció el sistema de clasificación de las plantas con flor o angiospermas (Sistema Cronquist), en las publicaciones An Integrated System of Classification of Flowering Plants (1981) y The Evolution and Classification of Flowering Plants (1988).
Manual of Vascular Plants of Northeastern United States and Adjacent Canada. Van Nostrand, Princeton, N.J. 1991, ISBN 0-89327-365-1 (con Henry A. Gleason)
The Natural Geography of Plants. 1964 (con Henry A. Gleason)
Vascular Plants of the Pacific Northwest. University of Washington Press, Seattle, Wash. (con Charles L. Hitchcock)
Vascular cryptogams, gymnosperms and monocotyledons, 1969
Salicaceae to Saxifragaceae, 1964
Saxifragaceae to Ericaceae, 1961
Ericaceae to Campanulaceae, 1959
Compositae, 1955
Flora of the Pacific Northwest. University of Washington Press, Seattle, Wash. 1974 (con Charles L. Hitchcock)