Fundado en septiembre de 1999 en Pekín por los investigadores Wang Jian, Yu Jun, Yang Huanming y Liu Siqi, el centro se creó como un instituto de investigación independiente del gobierno y representante de China dentro del Proyecto Genoma Humano. En su fundación el centro recibió el nombre, en inglés, de Beijing Genomics Institute (BGI)
En el año 2003, la Academia China de las Ciencias (CAS) creó un segundo centro denominado Beijing Institute of Genomics (BIG) en colaboración con el BGI y con Yang Huanming como director. Entre 2006 y 2007, ambas instituciones se dividieron, permaneciendo el BIG en Pekín, mientras que el Beijing Genomics Institute se trasladó a Shenzhen, su localización actual, cambiando su nombre a Grupo BGI.
En 2011, la Comisión Nacional de Desarrollo y Reforma de China (NDRC), el Ministerio de Finanzas, el Ministerio de Industria y Tecnología de la Información y el Ministerio de Salud y Protección Social aprobaron la creación del centro China National GeneBank y le encargaron al BGI su construcción en una asociación público-privada.
Beijing Genomics Institute
Beijing Genomics Institute (República Popular China)
↑Davies, Kevin (27 de septiembre de 2011). «The Bedrock of BGI: Huanming Yang». www.bio-itworld.com. Archivado desde el original el 14 de mayo de 2020. Consultado el 9 de septiembre de 2022.