Cottoidei fue propuesto por primera vez como grupo taxonómico en 1835 por el zoólogo suizo-estadounidenseLouis Agassiz. La quinta edición de Fishes of the World clasifica a Cottoidei como un suborden del orden Scorpaeniformes. Otros investigadores han descubierto que si el orden Scorpaeniformes, tal como se define en Fishes of the World, no se incluye en el orden Perciformes, este último se vuelve parafilético. Estos autores mantienen a los Cottoidei como un suborden dentro de Perciformes, pero incluyen a Zoarcoidei y a Gasterosteiformes como los infraórdenesZoarcales y Gasterosteales, reclasificando la mayoría de las superfamilias de Fishes of the World como infraórdenes. Actualmente, Eschmeyer's Catalog of Fishes lo mantiene como un suborden de los Perciformes.
Los otolitos fósiles de cottoideos datan del Ypresiense, mientras que los restos esqueléticos aparecen a partir del Rupeliense.
Subdivisiones
Cottoidei se divide en las siguientes superfamilias, familias y subfamilias:
12Nelson, Joseph S.; Grande, Terry C.; Wilson, Mark V. H. (28 de marzo de 2016). Fishes of the World(en inglés) (5 edición). John Wiley & Sons. pp.467-495. ISBN978-1-118-34233-6. Consultado el 21 de junio de 2026.
↑Mamoru Yabe (1985). «Comaprative Osteology and Myology of the Superfamily Cottoidea Pisces:Scorpaeniformes), and its Phylogenetic Classification». Memoirs off the Faculty of Fishes Hokkaido University32 (1): 1-130. S2CID81835479.