Restauración del metropolitanato
En 1241 la presencia latina en la ciudad de Larisa terminó y metropolitanato griego continuó en la ciudad.
El número de 16 diócesis sufragáneas todavía está documentado en un acta patriarcal a favor del metropolitano Nilo de 1371.
En la segunda mitad del siglo XIII Tesalia y la provincia eclesiástica de Larisa fueron excluidas del patriarcado de Constantinopla y puestas bajo la jurisdicción del patriarcado de Peć, hasta 1371. Durante este período, los metropolitanos se trasladaron durante un tiempo a Amykleion, y luego sobre todo a Tricca (hoy Tríkala), a 62 km al oeste de Larisa, y a menudo se les menciona en los documentos como «metropolitanos de Tricca». Larisa fue conquistada por el Imperio otomano entre 1386 y 1387, y de nuevo en la década de 1390, pero finalmente cayó bajo control otomano en 1423. Para el siglo XVI Larisa era una ciudad de mayoría musulmana y se convirtió en una ciudad sin cristianos debido a las invasiones y persecuciones, momento en el que la sede del metropolitanato se trasladó a Tríkala.
Entre los siglos XIV y XV el número de diócesis sufragáneas comenzó a disminuir, muchas de las cuales fueron absorbidas por Larisa, incluyendo las diócesis de Tricca, Stagoi y Cardicio. Durante el siglo XIX todas las diócesis sufragáneas de Larisa desaparecieron, ya sea por su fusión con la sede metropolitana o por su elevación al rango de sede metropolitana.
En el XVI, y especialmente en la segunda mitad del siglo XVII, cinco metropolitanos de Larisa fueron elegidos patriarcas de Constantinopla: Jeremías II, Paisio I, Dionisio III, Dionisio IV y Giacomo II.
Entre los siglos XVI y XVII la sede de Larisa estuvo ocupada por el metropolitano Dionisio IV, originario de Epiro, quien comenzó a predicar la lucha armada contra el sultán Mehmed III (1595-1603), lo que provocó represalias otomanas que sembraron la muerte y la destrucción en Tesalia. El patriarca consideró la actitud del metropolitano perjudicial para la Iglesia y lo depuso el 15 de mayo de 1601. Dionisio continuó su lucha, pero finalmente cayó víctima de la violencia que él mismo había incitado. Capturado, fue desollado vivo, y su piel, rellena de heno, fue transformada en una marioneta y luego quemada. Se le considera un santo en los dípticos de la Iglesia de Larisa.
Tras cuatro siglos, la sede del metropolitanato regresó a Larisa cuando el patriarca ecuménico Neófito III, en 1739, mediante su carta patriarcal sinodal, restableció la diócesis de Tríkala. Así, el metropolitano de Larisa, Iakovos II, regresó a la ciudad de Larisa. Desde entonces, Larisa ha sido la sede del metropolitanato.
En 1882 Tesalia pasó del Imperio otomano a Grecia; desde ese momento Larisa se convirtió en sede de la Iglesia ortodoxa de Grecia.
En 1900 la diócesis de Platamon, en territorio griego, que sin embargo dependía del metropolitanato de Tesalónica, en territorio otomano, fue suprimida y unida a la sede de Larisa, que a partir de este momento tomó el nombre de «metropolitanato de Larisa y Platamon».
En diciembre de 1917 el obispo Arsenio Afentoules fue depuesto por criticar al presidente de la República griega, exiliado y finalmente encarcelado; seis años más tarde, fue restituido en su cargo y funciones, y murió en 1934.
Durante el período 1922-1924, familias de refugiados griegos de Asia Menor se establecieron en la región de Larisa, como en el resto de Grecia, llevando consigo tradiciones y reliquias, enriqueciendo espiritual y culturalmente a la Iglesia local.
En 1956 el metropolitano Dorotheos Kottaras fue elegido arzobispo de Atenas, máxima autoridad de la Iglesia ortodoxa de Grecia.
De 1974 a 1989 el metropolitano Serafín Orphanos llevó de regreso las reliquias de san Aquilo a Larisa después de 1000 años.
En 1989 el título de «Larisa y Platamon» fue reemplazado por el de «Larisa y Tírnavos», una ciudad a unos 20 kilómetros al noroeste de Larisa.
Grecia
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