Paceibacteria

Paceibacteria
Taxonomía
Dominio: Bacteria
Reino: Bacillati
Filo: Minisyncoccota
Clase: Paceibacteria
Rinke et al. 2013
Órdenes
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Paceibacteria o Parcubacteria es una clase de bacterias recientemente propuesta sobre la base de análisis genómicos (Rinke 2013), al que usualmente se le asigna el rango de superfilo o filo. Previamente se conocía como filo candidato OD1 (Harris, 2004). Los análisis genéticos sugieren que sus especiales características metabólicas han prevenido hasta el momento su identificación y cultivo por los procedimientos tradicionales. Se caracterizan por células extremadamente pequeñas, genomas reducidos y capacidades metabólicas muy limitadas, centradas principalmente en la fermentación, que generalmente viven como simbiontes en comunidades microbianas.

Se ha encontrado un espécimen intracelular que habita en protistas ciliados. Otro espécimen con metabolismo del nitrógeno y de ácidos grasos, es la única bacteria CPR indentificada con vías inusuales y enzimas muy divergentes que le dan capacidad de respiración aeróbica.

Junto a la clase Microgenomatia y a otros taxones recientemente identificados de bacterias forma parte de Minisyncoccota o grupo CPR, que se estima que constituye al menos un 15% de la diversidad bacteriana.

Referencias

  1. 1 2 Brown, Christopher T., et al. Unusual biology across a group comprising more than 15% of domain Bacteria. Nature 523.7559 (2015): 208-211.
  2. ↑ Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, David W. Waite, Christian Rinke, Adam Skarshewski, Pierre-Alain Chaumeil, Philip Hugenholtz (2018). A proposal for a standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny. Biorxiv.
  3. ↑ Genome database. Patescibacteria.
  4. ↑ Rinke, C., Schwientek, P., Sczyrba, A., Ivanova, N. N., Anderson, I. J., Cheng, J. F., ... & Dodsworth, J. A. (2013). Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. Nature, 499(7459), 431-437.)
  5. ↑ Harris, J. K., Kelley, S. T., & Pace, N. R. (2004). New perspective on uncultured bacterial phylogenetic division OP11. Applied and Environmental Microbiology, 70(2), 845-849).
  6. ↑ Solden, Lindsey, Karen Lloyd, and Kelly Wrighton The bright side of microbial dark matter: lessons learned from the uncultivated majority. Current opinion in microbiology 31 (2016): 217-226.
  7. ↑ Jun Gong, Yao Qing, Xiaohong Guo & Alan Warren, 2014, “Candidatus Sonnebornia yantaiensis”, a member of candidate division OD1, as intracellular bacteria of the ciliated protist Paramecium bursaria (Ciliophora, Oligohymenophorea). Systematic and Applied Microbiology V. 37, Issue 1, p. 35-41
  8. ↑ Castelle, C., Brown, C., Thomas, B. et al. Unusual respiratory capacity and nitrogen metabolism in a Parcubacterium (OD1) of the Candidate Phyla Radiation. Sci Rep 7, 40101 (2017) doi:10.1038/srep40101
  9. ↑ Hug, Laura A., et al., A new view of the tree of life. Nature Microbiology 1 (2016): 16048.