SATB1

SATB1
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Lista de codigos id de PDB
	1YSE, 2L1P, 2O49, 2O4A, 3NZL, 3TUO, 2MW8
Identificadores
Alias	SATB1, SATB homeobox 1, DEFDA, KTZSL, DNA-binding protein SATB1/SATB2, SATB1/SATB2, IPR039673
IDs externos	OMIM: 602075 MGI: 105084 HomoloGene: 2232 GeneCards: SATB1
Ontología génica
Función molecular	• DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 unión a proteína plasmática; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • double-stranded DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding;
Componente celular	• PML body; • nuclear matrix; • Nucleoplasma; • cromatina; • núcleo celular; • nuclear body;
Proceso biológico	• reflejo; • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation; • CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation; • Remodelación de la cromatina; • activated T cell proliferation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • transcription, DNA-templated; • epidermis development; • histone methylation; • GO:0022415 proceso viral; • T cell activation;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Patrón de la expressión del ARN
	Más referencias a datos de expressión
Ortólogos
	6304
	20230
	ENSG00000182568
	ENSMUSG00000023927
	Q01826
	Q60611
NM_001131010; NM_001195470; NM_002971; NM_001322871; NM_001322872;
	NM_001322873; NM_001322874; NM_001322875; NM_001322876
NM_001163630; NM_001163631; NM_001163632; NM_009122; NM_001357636;
	NM_001357637; NM_001357638; NM_001357640
NP_001124482; NP_001182399; NP_001309800; NP_001309801; NP_001309802;
	NP_001309803; NP_001309804; NP_001309805; NP_002962
NP_001157102; NP_001157103; NP_001157104; NP_033148; NP_001344565;
	NP_001344566; NP_001344567; NP_001344569
	Wikidata
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La proteína 1 de unión a secuencias ricas en AT (SATB1) es una proteína codificada en humanos por el gen SATB1.

Función

SATB1 es un factor de transcripción y un organizador global de la cromatina, que ha emergido como un factor clave en la integración de la arquitectura de la cromatina por medio de regulación de la expresión génica. Estudios recientes han revelado el papel de SATB1 en la organización de la cromatina loopscape y su naturaleza dinámica en respuesta a estímulos fisiológicos. A nivel de genoma, SATB1 parece desempeñar un papel importante en la organización de la cromatina transcripcionalmente activa. SATB1 organiza el locus del MHC-I en distintos bucles de la cromatina, mediante el reclutamiento de MARs a la matriz nuclear a una distancia fija. El silenciamiento de SATB1 mimetiza los efectos del tratamiento con interferón gamma en la arquitectura de la cromatina del locus del MHC-I, y altera la expresión de genes dentro de ese locus. SATB1 también parece inducir cáncer de mama y metástasis debido a la alteración de la expresión de numerosos genes.

Interacciones

La proteína SATB1 ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

Referencias

↑ «Human PubMed Reference:».
↑ «Mouse PubMed Reference:».
↑ «Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1».
↑ Pavan Kumar P, Purbey PK, Sinha CK, Notani D, Limaye A, Jayani RS, Galande S (abril de 2006). «Phosphorylation of SATB1, a global gene regulator, acts as a molecular switch regulating its transcriptional activity in vivo». Mol. Cell 22 (2): 231-43. PMID 16630892. doi:10.1016/j.molcel.2006.03.010.
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↑ Durrin, Linda K; Krontiris Theodore G (Jun. de 2002). «The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11». Genomics (United States) 79 (6): 809-17. ISSN 0888-7543. PMID 12036295. doi:10.1006/geno.2002.6772.

Enlaces externos

Literatura del gen SATB1 a través de RARe-SOURCE
En HomoloGene: SATB1

En Genome:SATB1
En MalaCards.Enfermedades que coinciden con:SATB1
En Estudio de asociación del genoma completo (GWAS) SATB1

Datos: Q18031378
Multimedia: DNA-binding protein SATB1 / Q18031378

[1] «Human PubMed Reference:».

[2] «Mouse PubMed Reference:».

[entrez-3] «Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1».

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[pmid12036295-8] Durrin, Linda K; Krontiris Theodore G (Jun. de 2002). «The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11». Genomics (United States) 79 (6): 809-17. ISSN 0888-7543. PMID 12036295. doi:10.1006/geno.2002.6772.