Jaan Simisker (16. november 1937 – 17. märts 2002) oli eesti bioloog.
Ta õppis Tartu Riiklikus Ülikoolis bioloogiat aastail 1957–1962. Ta töötas Tartu Ülikoolis taimefüsioloogia ja -biokeemia kateedris dotsendina. Ta tegeles mikrobioloogia, biofüüsika ja biokeemiaga.
Tema õde oli Leenu Siimisker.