Keeni Põhikool on põhikool Valga maakonnas Otepää vallas Keeni külas. Kooli direktor on Tanel Meiel.
Keeni kool tegutses ajavahemikus 1840–1930 Kihul (varem Kiho). Viimane Kihul asuv koolimaja ehitati 1903 ja põles maha 17. septembril 1930.
Aastatel 1938–1988 tegutses Keeni kool Keeni mõisa peahoones.