Maaja Toompuu (sündinud 10. märtsil 1948) on Eesti riigiametnik.
Maaja Toompuu on teenistuses olnud Lääne maavalitsuse rahandusosakonna juhataja ja Lääne maavanema kohusetäitjana aastal 1999 ning aastail 2007–2008.
| Eelnev Arder Väli |
Lääne maavanem (kohusetäitja) 21. juuli 1999 – 21. september 1999 |
Järgnev Jaanus Sahk |
| Eelnev Sulev Vare |
Lääne maavanem (kohusetäitja) 2007–2008 |
Järgnev Neeme Suur |