Veeseened on veekeskkonnas elavad seened. Paljud veeseened kuuluvad vetik-, kott- ja teisseente hulka.
Enamik veeseeni toitub saprotroofselt, s.t veekogus leiduvatest taime- ja loomajäänustest, vähemik on veeloomade (kalade, lülijalgsete), vetikate ja kõrgemate veetaimede parasiidid või kommensaalid.