Aleksi Yrjänä Mainio (s. 1979) on suomalainen filosofian tohtori ja poliittisen historian tutkija.
Mainio väitteli tohtoriksi vuonna 2015 Helsingin yliopistossa, väitöskirja käsitteli valkoisten venäläisten emigranttien aseellisten ryhmien toimintaa Suomesta käsin Neuvostoliittoa vastaan 1918–1939. Vuosina 2020–2025 Mainio toimi hankepäällikkönä Kansallisarkiston tutkimushankkeessa, jossa selvitettiin suomalaisten kohtaloita Neuvostoliitossa vuosina 1917–1964.
Aleksi Mainiolle myönnettiin Urho Kekkosen 70-vuotisjuhlasäätiön palkinto kirjasta Terroristien pesä : Suomi ja taistelu Venäjästä 1918–1939.