Andres Mustonen (s. 1. syyskuuta 1953 Tallinna) on virolainen kapellimestari ja viulisti. Hänet tunnetaan erityisesti vanhan musiikin yhtyeen Hortus Musicus perustajana ja johtajana. Hän perusti Hortus Musicus -yhtyeen vuonna 1972 ollessaan viulunsoiton opiskelija Viron musiikkiakatemiassa. Mustonen on esiintynyt vierailevana kapellimestarina eri puolilla maailmaa – myös Suomessa –, ja hänen ohjelmistonsa ulottuu vanhasta musiikista nykysäveltäjiin.
