EC-numero

EC-numero (Enzyme Commission) on entsyymien katalysoimiin reaktioihin perustuva niiden luokitteluun käytettävä numerosarja.

Historia

Entsyymien nimeäminen on ollut sekavaa ja yleisesti käytetyt triviaalinimet eivät välttämättä kertoneet tarkasti entsyymin katalysoimasta reaktiosta. Niinpä IUBMB perusti komitean selkeyttämään entsyymien nimeämistä. Komitean työn tuloksena valmistui vuonna 1961 ensimmäinen versio entsyymien luokittelusta, jossa entsyymit jaettiin kuuteen luokkaan niiden katalysoimien reaktioiden mukaan.

EC-numeron muodostaminen

EC-numero koostuu Tunnuksesta EC ja neljästä luvusta, jotka erotetaan toisitaan pisteillä. Ensimmäinen numero kertoo pääluokan, johon entsyymi kuuluu ja minkä tyyppistä reaktiota se katalysoi. Toinen numero kertoo alaluokan ja lisätietoa reaktiosta. Kolmas numero antaa lisätietoa reaktiosta ja neljäs numero kertoo substraattispesifisyyden.

Entsyymien pääluokat

Ryhmä	Katalysoitu reaktio	Tyypillinen reaktio
EC1.x.x.x Oksidoreduktaasit	Hapetus-pelkistysreaktio	AH + B → A + BH (pelkistynyt) A + O → AO (hapettunut)
EC2.x.x.x Transferaasit	Ryhmänsiirto substraatilta toiselle	AB + C → A + BC
EC3.x.x.x Hydrolaasit	Hydrolyysi	AB + H₂O → AOH + BH
EC4.x.x.x Lyaasit	Eliminaatio muodostaen kaksoissidoksia tai renkaita, additio kaksoissidokseen	[X-A-B-Y] → [A=B + X-Y]
EC5.x.x.x Isomeraasit	Isomerointi	AB → BA
EC6.x.x.x Ligaasit	Substraattien välisen sidoksen muodostaminen ATP-molekyylin hydrolyysin vapauttaman energian avulla	X + Y+ ATP → XY + ADP + Pi

Lähteet

1 2 3 4 Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko & Lubert Stryer: Biochemistry, 6th Edition, s. 236–237. W. H. Freeman and Company, 2006. ISBN 978-0-7167-8724-2 (englanniksi)
1 2 3 4 Classification and Nomenclature of Enzymes by the Reactions they Catalyse Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB). Viitattu 12.7.2011. (englanniksi)
↑ Torsten Schwede,Manuel Claude Peitsch: Computational structural biology, s. 193. World Scientific, 2008. ISBN 978-981-277-877-2 Kirja Googlen teoshaussa Viitattu 12.07.2011. (englanniksi)

Aiheesta muualla

Enzyme nomenclature IUBMB
BRENDA Enzyme Database (englanniksi)

Tämä biologiaan liittyvä artikkeli on tynkä. Voit auttaa Wikipediaa laajentamalla artikkelia.

[Biochemistry-1] 1 2 3 4 Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko & Lubert Stryer: Biochemistry, 6th Edition, s. 236–237. W. H. Freeman and Company, 2006. ISBN 978-0-7167-8724-2 (englanniksi)

[classification-2] 1 2 3 4 Classification and Nomenclature of Enzymes by the Reactions they Catalyse Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB). Viitattu 12.7.2011. (englanniksi)

[3] Torsten Schwede,Manuel Claude Peitsch: Computational structural biology, s. 193. World Scientific, 2008. ISBN 978-981-277-877-2 Kirja Googlen teoshaussa Viitattu 12.07.2011. (englanniksi)