Ekoalue on ekologisesti ja maantieteellisesti määritelty luonnonmaantieteellinen alue, joka on osa suurempaa luonnonmaantieteellistä suuraluetta, eli biomia. Ekoalueen määrittelee sille yhtenäinen kasvisto, eläimistö ja ekosysteemi.
Ekoalueiden rajat eivät ole tarkasti määriteltyjä, ja yksittäinen alue muodostuu alueesta, jossa vaikuttavat tietyt ekologiset ja evolutionääriset tekijät. WWF:n määritelmän mukaan ekoalue on ”maantieteellisesti yhtenäinen suurehko maa- tai vesialue, jossa esiintyy määrättyjä eliölajeja ja -yhteisöjä sekä elinympäristöjä. WWF jakaa maa-alueet 14 biomiin ja edelleen 867 ekoalueeseen.