Grafeemi on kirjoitusjärjestelmän pienin distinktiivinen yksikkö, joka erottaa yhden merkityksen toisesta. Grafeemityyppejä ovat kirjoitusmerkit (kuten kirjaimet, tavumerkit ja logogrammit) sekä välimerkit ja ideogrammit.
Saman grafeemin pieni kirjain ja iso kirjain (kuten a ja A) ovat allografeja eivätkä eri grafeemeja, sillä ne eivät erota merkitystä.
Grafeemilla voidaan tarkoittaa myös kirjoituksen jaksoa, jolla merkitään yhtä foneemia.