Manuel Cardoso (kastettu 11. joulukuuta 1566 – 24. marraskuuta 1650) oli portugalilainen säveltäjä ja urkuri.
Cardoso syntyi Fronteirassa, lähellä Portalegrea todennäköisesti vuonna 1566. Hän aloitti musiikin harrastamisen laulamalla kuorossa. Vuonna 1588 Cardoso liittyi karmeliittoihin. Hän kuoli Lissabonissa vuonna 1650.
Cardoso kirjoitti messuja, motetteja ja muuta kirkkomusiikkia. Monet säveltäjän teokset tuhoutuivat Lissabonin maanjäristyksessä vuonna 1755. Häneltä on säilynyt muun muassa kolme kirjaa messuja.lähde?