Markus Pirttijoki (s. 21. maaliskuuta 1975 Södertälje, Ruotsi) on suomalainen päätoimittaja.
Pirttijoki on työskennellyt Kuhmolaisessa, Aamulehdessä, Kauppalehdessä ja MTV3:ssa ennen kuin aloitti Kainuun Sanomien päätoimittajana 1. toukokuuta 2013.
Kainuun Sanomista Pirttijoki siirtyi 1. helmikuuta 2019 Etelä-Suomen Sanomien vastaavaksi päätoimittajaksi. Hän toimii myös Etelä-Suomen Sanomien lailla Keskisuomalainen-konserniin kuuluvan Seutuneloset-lehtiryhmän päätoimittajana.
Pirttijoki on Hämeen maakuntajoukkojen tukiyhdistys Varmistin ry:n valtuuskunnan jäsen.