Termi megakoolon (engl. megacolon) viittaa lääketieteessä epätavallisen laajentuneeseen paksusuoleen. Tila voi olla akuutti tai krooninen.
Chagasin tauti on megakoolonin maailmanlaajuisesti yleisin aiheuttaja. Se voi johtua myös antipsykoottien pitkäaikaiskäytöstä.
Toksinen megakoolon on muihin suolistosairauksiin, kuten haavaiseen koliittiin tai Crohnin tautiin liittyvä mahdollinen, mutta harvinainen ja hengenvaarallinen komplikaatio. Megakoolon voi olla myös esimerkiksi synnynnäinen. Aganglioninen megakoolon tarkoittaa Hirschsprungin tautia.
Ummetus ja vatsan turvotus lukeutuvat megakoolonin mahdollisiin oireisiin.