Erityisesti orgaanisessa kemiassa metoksi viittaa funktionaaliseen ryhmään, jossa metyyliryhmä on sitoutunut happeen. Tämän alkoksiryhmän kaava on O–CH3.
Dimetyylieetteri sisältää kaksoismetoksiryhmän; muita metoksieettereitä ovat metoksietaani ja metoksipropaani. Metoksiryhmä esiintyy meskaliinissa ja sen johdoksissa, kuten 2C-B, 2C-E ja 2C-P.