NHL-ura
Marner pelasi ensimmäisen ottelunsa NHL:ssä Toronto Maple Leafsin kokoonpanossa 12. lokakuuta 2016. Ensimmäisen maalinsa NHL:ssä hän teki toisessa ottelussaan Boston Bruinsia vastaan neljä vuorokautta myöhemmin. Marner vakiinnutti nopeasti asemansa tärkeänä hyökkäyspään pelaajana. Hän johti kaikkia tulokkaita syöttöpisteissä ja tehopisteissä tammikuussa 2017, tehden Maple Leafs -tulokkaiden ennätyksen 42 syöttöpisteellä kauden aikana. Hän päätti tulokaskautensa 61 tehopisteellä. Seuraavalla kaudella Marner jatkoi menestystään, saavuttaen ensimmäiset neljän ja viiden tehopisteen ottelunsa, johtaen joukkueen syöttö- ja tehopistetilastoja sekä tehden uusia henkilökohtaisia ennätyksiä kaikissa hyökkäyskategorioissa. Hän johti Leafsia pudotuspelien pistetilastoissa, vaikka joukkue putosi ensimmäisellä kierroksella.
Kausi 2018–2019 näki Marnerin nousun jatkuvan, kun hänestä tuli ensimmäinen Maple Leafs -pelaaja, joka aloitti NHL-uransa kolmella peräkkäisellä yli 60 tehopisteen kaudella. Hän teki uransa parhaat lukemat 26 maalilla, 68 syöttö- ja 94 tehopisteellä, ollen ensimmäinen Maple Leafs -pelaaja Mats Sundinin jälkeen (kaudella 1996–1997), joka teki yli 90 tehopistettä yhden kauden aikana. Syyskuussa 2019 hän allekirjoitti kuusivuotisen, 65,358 miljoonan dollarin jatkosopimuksen ja nimettiin joukkueen varakapteeniksi. Vaikka nilkkavamma haittasi hänen kauttaan 2019–2020, hän saavutti silti uransa toisen viiden pisteen ottelun ja hänet valittiin ensimmäistä kertaa NHL:n tähdistöotteluun. Leafsien pudotuspeliesitykset vuoden 2020 "kuplassa" kuitenkin toivat Marnerille kritiikkiä tuottavuuden puutteesta, kun joukkue hävisi karsintakierroksella.
Koronaviruspandemian lyhentämällä kaudella 2020–2021 Marnerista tuli neljäs Maple Leafs -pelaaja, joka on tehnyt vähintään 40 syöttöpistettä viidellä peräkkäisellä kaudella. Hänet nimettiin NHL:n ykköstähdistöön, mikä oli ensimmäinen kerta Maple Leafs -pelaajalle sitten vuoden 1977. Yksittäisestä kunnianosoituksesta huolimatta joukkue koki jälleen pettymyksen pudotuspeleissä, häviten Montreal Canadiensille seitsemässä ottelussa, ja Marnerin pudotuspelisuoritukset herättivät jälleen kritiikkiä. Kaudella 2021–2022 Marner pelasi jälleen erittäin menestyksekkään runkosarjan, tehden 35 maalia ja 62 syöttöpistettä 72 ottelussa, mukaan lukien uransa parhaan neljän maalin ja kuuden tehopisteen ottelun. Hänet nimettiin jälleen NHL:n ykköstähdistöön. Leafsien pudotuspelien vaikeudet kuitenkin jatkuivat, pidentäen heidän tappioputkeaan pudotuspeleissä.
Kausi 2022–2023 oli Marnerille loistava, kun hän teki seuran ennätyksen 23 ottelun pisteputkella ja päätti kauden 99 tehopisteellä. Hän oli ehdolla Frank J. Selke Trophyn saajaksi liigan parhaana puolustavana hyökkääjänä. Marnerilla oli keskeinen rooli Maple Leafsin ensimmäisessä pudotuspelisarjavoitossa sitten vuoden 2004, kun hän johti joukkuetta 11 tehopisteellä voitossaan Tampa Bay Lightningista. Kaudella 2023–2024 hän teki 85 tehopistettä 69 ottelussa. Hänen viimeisellä sopimuskaudellaan, 2024–2025, hän teki uransa kolmannen hattutempun ja sivusi Doug Gilmouria ja Börje Salmingia viidenneksi eniten ottelun avausmaaleja tehneenä Maple Leafs -pelaajana. Kauden aikana hän kieltäytyi siirrosta Carolina Hurricanesiin. Vaikka Maple Leafs eteni pudotuspelien ensimmäiseltä kierrokselta, joukkue hävisi lopulta toisen kierroksen seitsemännessä ottelussa Florida Panthersille, Marnerin tehdessä 13 tehopistettä 13 pudotuspeliottelussa.
Kesäkuussa 2025 Leafs kauppasi Marnerin Vegas Golden Knightsiin ja välittömästi kaupan jälkeen Marner teki Golden Knightsin kanssa kahdeksanvuotisen ja yhteensä 96 miljoonan dollarin arvoisen sopimuksen, jonka vuosittainen keskiansio oli 12 miljoonaa dollaria.
Kanada
Olympialaiset
Hopeaa
Kultaa
