Walter Karstenin vanhemmat olivat alikapteeni Theodor Karsten ja Sofia Wilhelmina Winter ja puoliso vuodesta 1898 Anna Elvina Juslén (k. 1939). Karsten tuli ylioppilaaksi 1889 ja valmistui filosofian kandidaatiksi 1893, proviisorin tutkinnon hän suoritti 1895. Hän opiskeli myös Berliinin yliopistossa 1901–1902 ja teki opintomatkoja ulkomaille. Karsten toimi apteekkarina Tammisaaressa 1896–1898 ja Helsingissä vuodesta 1898. Hän tutki muun muassa farmasiaa ja apteekkilaitoksen historiaa Suomessa, julkaisten tutkimuksia ja alaa koskevia teoksia sekä suosituksia ja mietintöjä. Hänellä oli myös useita oman alansa asiantuntija- ja luottamustehtäviä.
Julkaisuja
Apoteksväsendets i Finland: historik och författningar, 1901
Betänkande i den farmaceutiska förbildningsfrågan samt förslag till införande af en subalter personal vid apoteken i Finland, 1903
Finlands apotekare II, 1909
Komiteamietintö Keisarilliselle Majesteetille rohdoskauppaa koskevan, 24 päivänä tammikuuta 1888 annetun Armollisen asetuksen tarkastamista varten asetettu komitea, 1910, B. J. Bask, A. W. Forsberg, Walter Karsten, Arvid Krogerus, V. O. Sivén
Bidrag till Utredning af apoteksfrågan: 1, Tillkomsten af reglementet för apotekare af den 12 februari 1799 jämte afskrifter af samtliga i frågan tillkomna förslag, utlåtanden m.m, 1912
Farmaceuternas pensionskassa i Finland 1865–1915, 1916
Förslag till förordning om apoteken i Finland, 1916 (käsikirjoitus)
De farmaceutiska korporationernas förslag till förordning angående apoteken i Finland jämte betänkande och motivering, 1918
Farmaceutiska föreningen i Finland trettio år: 1887–1917: enligt uppdrag af Farmaceutiska föreningen, 1919
Katalog öfver Farmaceutiska biblioteket, 1919
Medica toiminut 10 vuotta 1914–1924, 1924
Suomen farmasian historiaa: Farmaseuttinen yhdistys 1887–1927, 1927
Förslag till utlåtande om ett av en statskommitté utarbetat förslag till ett enhetligt apoteksreglemente, om vars avgivande medicinalstyrelsen i skrivelse av den 15 februari 1933 hos Finska läkaresällskapet anhållit, 1933, Walter Karsten, Elis Lövegren, Elis Kuhlefelt
Farmacins historia i Finland, 1933
Stads- och provincialapoteket i Åbo: apoteket vid salutorget 250 år (1689–1939): en skildring, 1939
