Baselios Cleemis (né Isaac Thottunkal le à Tirumoola au Kerala en Inde) est un évêque et cardinal indien des Syro-malankares.
Il est l'actuel archevêque majeur de Trivandrum et en tant que tel primat de l'Église catholique syro-malankare, depuis le .
Avant sa nomination à la tête de l'Église catholique syro-malankare, Baselios Cleemis était archevêque métropolitain de Tiruvalla.
Il est créé cardinal lors du consistoire du 24 novembre 2012 en lui assignant le titre cardinalice de cardinal-prêtre de San Gregorio VII. Il participe au conclave de 2013 qui élit le pape François puis au conclave de 2025 qui élit le pape Léon XIV.
Le il est nommé par le pape François : Père synodal pour la troisième assemblée générale extraordinaire du synode des évêques sur la famille qui se déroulera du 5 au en qualité de primat de l'Église syro-malankare.