Il fait suite au Comité interministériel permanent pour les problèmes d'action régionale et d'aménagement du territoire (CIAT) créé en 1960, remplacé en 1995 par le Comité interministériel d'aménagement et de développement du territoire (CIADT), puis en 2005 par le Comité interministériel d'aménagement et de compétitivité des territoires (CIACT), qui retourne en 2009 à la dénomination de 1995.
Plus tard, sous le nom de Comité interministériel permanent pour les problèmes d'action régionale et d'aménagement du territoire (CIADT), le comité se réunit le et le .
Le , labellisation de 67 pôles de compétitivité. Le , le comité se réunit sur les points suivants: labellisation de nouveaux pôles de compétitivité dans le domaine des éco-technologies, et adoption d'un plan d'action en faveur des territoires ruraux, résultant des Assises des territoires ruraux.
Grands projets
8 projets de lignes nouvelles à grande vitesse (LGV)
Contournements urbains (Strasbourg, Arles, Bordeaux, tunnel de Toulon…)
3 grandes liaisons routières d’aménagement du territoire
La Route Centre-Europe Atlantique: accélération de la mise à 4 voies des nationales existantes et inscription au schéma autoroutier de la liaison Niort - Limoges
Le CIACT du porte entre autres sur les points suivants: remplacement de la DATAR par une Délégation interministérielle à l'aménagement et à la compétitivité des territoires (DIACT), poursuite de la mise en œuvre des pôles de compétitivité dont la liste avait été établie lors du CIADT du , grands projets d'infrastructure (LGV Rhin-Rhône, Autoroute A65 entre Bordeaux et Pau), transports collectifs urbains en Île-de-France et dans les métropoles de province., et appel au financement privé par le système de la concession et celui des contrats de partenariat public-privé.
Le CIACT du est notamment à l'origine de l'Opération d'intérêt national (OIN) de Massy Palaiseau Saclay Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines. Il prépare également les contrats de projet État-région 2007-2013. Le CIACT du procède à la labellisation de cinq nouveaux pôles de compétitivité. Le CIACT du adopte la répartition territoriale du plan de relance, comprenant plus de 1 000 opérations réparties dans l'ensemble des régions.