Deltaproteobacteria
Cet article est une ébauche concernant la microbiologie.
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Règne | Pseudomonadati |
| Phylum | Pseudomonadota |
- Desulfobaccia Waite et al. 2020
- Desulfobulbia Waite et al.. 2020
- Desulfomonilia Waite et al. 2020
- Syntrophia Waite et al. 2020
- Polyangiia corrig. Waite et al. 2020
- Syntrophorhabdia Waite et al. 2020
- Desulfovibrionia Waite et al. 2020
- Syntrophobacteria Waite et al. 2020
- Desulfobacteria Waite et al. 2020
- Myxococcia Waite et al. 2020
- Desulfarculia Waite et al. 2020
- Desulfuromonadia Waite et al. 2020
- Desulfurellia Waite et al. 2020
- Deferrisomatia Waite et al. 2020
- Dissulfuribacteria Waite et al. 2020
- Deltabacteria Cavalier-Smith 2002
Les Deltaproteobacteria (en français les Deltaprotéobactéries) sont une classe de bactéries à Gram négatif du phylum des Pseudomonadota. Son nom, formé sur les mots grecs delta (δέλτα : quatrième lettre de l'alphabet) et Proteus (Προτεύς : Protée, dieu capable de se métamorphoser) complétés du néolatin bacteria (bactérie), n'est exceptionnellement pas dérivé du nom de son genre type Myxococcus.
Taxonomie
Ce taxon est décrit en 2006 par J. Kuever et al. dans la deuxième édition du Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Il est validé la même année par une publication dans l'IJSEM.
En 2020, s'appuyant sur un séquençage des gènes de l'ARN ribosomique et de 120 gènes marqueurs non dupliqués, D.W. Waite et al. réfutent la monophylie des Deltaproteobacteria et leur inclusion dans le phylum des Proteobacteria (devenu Pseudomonadota). Ces auteurs proposent de réorganiser le groupe « Deltaproteobacteria-Oligoflexia-Thermodesulfurobacteria » en le subdivisant en quatre nouveaux phyla : Bdellovibrionota, Desulfurobacterota, Myxococcota et un quatrième taxon nommé provisoirement « SAR324 ».
À la suite de ces travaux, neuf ordres auparavant comptés dans les Deltaproteobacteria (Deferrisomatales, Desulfarculales, Desulfobacterales, Desulfovibrionales, Desulfuromonadales, Deferrisomatales, Dissulfuribacterales, Syntrophobacterales et Syntrophorhabdales) sont transférés au sein de classes ad hoc dans le phylum des Thermodesulfobacteriota nouvellement créé. L'ordre des Bdellovibrionales est maintenu dans le phylum des Pseudomonadota mais transféré dans la classe des Oligoflexia.
Liste d'ordres
Ordres publiés de manière valide
Selon la LPSN () :
- Bradymonadales Wang et al. 2015
- Desulfurellales Kuever et al. 2006
- Myxococcales Tchan et al. 1948
- Polyangiales Waite et al. 2020
Les deux ordres suivants ont été reclassés :
- Haliangiales Waite et al. 2020 : reclassé en Myxococcales Tchan et al. 1948
- Nannocystales (Reichenbach 2007) Waite et al. 2020 : reclassé en Myxococcales Tchan et al. 1948
Ordres en attente de publication valide
Selon la LPSN () les ordres suivants sont en attente de publication valide (Ca. signifie Candidatus) :
- « Ca. Acidulidesulfobacterales » corrig. Tan et al. 2019
- « Ca. Adiutricales » Waite et al. 2020
- « Ca. Desulfofervidales » Waite et al. 2020
Notes et références
- 1 2 (en) Jan Kuever, Fred A. Rainey et Friedrich W. Widdel, « Class IV. Deltaproteobacteria class nov. », dans D. J. Brenner, N. R. Krieg, J. T. Staley, G. M. Garrity, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology : The Proteobacteria, part C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria), vol. 2, New York, Springer, , 2e éd., XXVIII-1388 p. (ISBN 978-0387-24145-6, BNF 39993051)
- ↑ Euzéby JP « Validation list no. 107. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published » Int J Syst Evol Microbiol. 2006;56(1):1-6. Accès libre.
- ↑ Waite DW et al. « Proposal to reclassify the proteobacterial classes Deltaproteobacteria and Oligoflexia, and the phylum Thermodesulfobacteria into four phyla reflecting major functional capabilities » Int J Syst Evol Microbiol. 2020;70(11):5972–6016. Accès libre.
- ↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le .
- ↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le .
