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Ellen Kandeler (née le à Berlin) est une biologiste et agronome allemande, spécialisée sur la biologie du sol à l'Université de Hohenheim à Stuttgart. Elle dirige le secteur biologie du sol au sein du projet européen Biofector,.
Après avoir passé son baccalauréat à Vienne en 1975, Ellen Kandeler étudie la biologie à l'Université de Vienne et obtient son diplôme en 1979. Elle y réalise ensuite un doctorat en physiologie végétale.
Par la suite, elle est collaboratrice scientifique à l'Institut fédéral de l'étude des sols à Vienne de 1983 à 1995 ainsi que lectrice à l'Institut d'agrologie et d'ingénierie géologique, à l'Université pour la science des sols et à l'Institut zoologique de Vienne de 1987 à 1998. En parallèle, Ellen Kandeler obtient son habilitation universitaire (Venia legendi) dans le domaine d'étude de la biologie des sols à l'université pour la science des sols et elle dirige le département de microbiologie et le Centre de recherche de l'Office fédéral de l'Agriculture à Vienne entre 1995 et 1998. Elle devient également maîtresse de conférences en biologie et écologie des sols à la faculté d'agriculture de l'université de Halle-Wittemberg.
En 1998, Ellen Kandeler est nommée professeure dans le domaine de la biologie des sols à l'Institut agronomique de l'université de Hohenheim.
Elle est membre de plusieurs sociétés scientifiques :