Haplogroupe D

En génétique humaine, l’haplogroupe D (CTS3946) est un haplogroupe du chromosome Y.

L'haplogroupe D est supposé être originaire d’Afrique et D-M174 (D1) s’est étendu à l’Asie de l'Est. Une étude publiée en 2019 a examiné plusieurs possibilités pour l'origine de l'haplogroupe D, y compris une origine ouest-asiatique et africaine, et privilégie une origine africaine^,.

Distribution

La plus forte proportion de porteurs de l'haplogroupe D se trouve au Tibet, au Japon et dans les îles Andaman. Cependant on ne trouve curieusement pas ce groupe en Inde. Les Aïnous du Japon se partagent entre l'haplogroupe D et l'haplogroupe C. Ainsi, l'haplogroupe D1b1, déjà présent chez des individus de la période Jōmon, est présent dans les populations japonaises modernes mais presque absent chez les autres Asiatiques de l'Est.

L'analyse des lignées paternelles des Onges, un peuple australasien des îles Andaman, montre que tous les individus étudiés sont porteurs de l'haplogroupe D.

Sous-groupes

DE (YAP)
- D (CTS3946) ?
  - D1 (M174, IMS-JST021355)
    - D1a (CTS11577)　
      - D1a1 (F6251/Z27276)
        D1a1a (M15)　Tibet
        
        D1a1b (P99)　Tibet, Mongolie, Asie centrale
      - D1a2 (M64.1, M55)　Japon
      - D1a3 (Y34637)　Îles Andaman（Onges, Jarawas)
    - D1b (L1378)　Philippines
  - D2 (A5580.2)　Nigeria, Arabie saoudite, Syrie

Références

↑ (en) M. Haber, A.L. Jones, B.A. Connel, Asan, E. Arciero, Y. Huanming, M.G. Thomas, Y. Xue et Chris Tyler-Smith, « A Rare Deep-Rooting D0 African Y-chromosomal Haplogroup and its Implications for the Expansion of Modern Humans Out of Africa », Genetics,‎ juin 2019 (DOI 10.1534/genetics.119.302368).
1 2 (en) Chris Tyler-Smith, Yali Xue, Mark G. Thomas, Huanming Yang, Elena Arciero, Asan, Bruce A. Connell, Abigail L. Jones et Marc Haber, « A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans out of Africa », Genetics,‎ 13 juin 2019, genetics.302368.2019 (ISSN 0016-6731, PMID 31196864, DOI 10.1534/genetics.119.302368, lire en ligne).
↑ (en) Jienan Li, Feng Song, Min Lang and Mingkun Xie, Comprehensive insights into the genetic background of Chinese populations using Y chromosome markers, royalsocietypublishing.org, 20 septembre 2023, doi.org/10.1098/rsos.230814.
↑ (en) Niall P. Cooke, Valeria Mattiangeli et al.,Ancient genomics reveals tripartite origins of Japanese populations, Science Advances, Vol 7, Numéro 38, 17 septembre 2021, DOI:10.1126/sciadv.abh2419.
↑ (en) Mark Lipson et David Reich, « Working model of the deep relationships of diverse modern human genetic lineages outside of Africa », Molecular Biology and Evolution, 2017 (ISSN 0737-4038, PMID 28074030, PMCID 5400393, DOI 10.1093/molbev/msw293), p. 889–902.
1 2 3 Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082.
↑ « D YTree », sur www.yfull.com (consulté le 3 septembre 2019).
↑ Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2014.
↑ (en-US) Roberta Estes, « Exciting New Y DNA Haplogroup D Discoveries! », sur DNAeXplained - Genetic Genealogy, 21 juin 2019 (consulté le 8 juillet 2019).