De 2014 à 2015, Isabelle Alfonsi anime un cycle de conférences organisé par le Centre d'art contemporain d'Ivry-sur-Seine (Crédac). Elle y aborde notamment la question des identités de genre dans les pratiques artistiques contemporaines.
En 2018, Isabelle Alfonsi signe la préface de l'ouvrage Art queer. Une théorie freak de Renate Lorenz.
En 2019, elle publie aux éditions B42, Pour une esthétique de l’émancipation. Construire les lignées d’un art queer, un ouvrage qui propose une relecture de l'histoire de l'art sous le prisme du féminisme et du queer,. Elle reprend le concept de lignées à la philosophe Geneviève Fraisse. L'ouvrage s'appuie sur des recherches menées entre Paris et San Francisco.
Art Queer. Une théorie freak, Renate Lorenz, Isabelle Alfonsi et Mathieu Kleyebe Abonnenc, éditions B42, Arts et spectacles, 2018(ISBN978-2-917855-93-5)
Pour une esthétique de l’émancipation. Construire les lignées d’un art queer, Paris, éditions B42, , 160p. (ISBN978-2490077137)
12Archives of Women Artists Research & Exhibitions (AWARE), La Monnaie de Paris, Art: genre féminin, Paris/92-Chaville, Université Paris 1, Panthéon Sorbonne, Actes de Colloque, , 142p. (ISBN9782956053323), p.133