La manipulation d'un objet consiste à le prendre en main (sens premier du terme connu dès le XIVesiècle: poignée de blé, poignée de fleurs... pour l'examiner, le découvrir, le faire fonctionner, le porter ou le déplacer.
L'usage médical de manipulation dérive de ce premier sens. Dans le domaine des sciences, une manipulation est l'exécution d'une procédure (primitivement manuelle) sur des substances ou des objets, dans une recherche scientifique fondée sur la méthode expérimentale.
Particulièrement, la manipulation est un exercice de prestidigitation qui repose sur l'adresse manuelle et la dextérité du mouvement, et qui permet par exemple de donner l'illusion aux spectateurs de faire disparaître et réapparaître divers objets.
Manipulation vertébrale: technique de traitement des douleurs mécaniques bénignes réversibles du rachis, lorsque celles-ci présentent un dérangement intervertébral mineur ou un serrage articulaire réflexe;