Manuel Ruedi nait à La Chaux-de-Fonds le . Il obtient un diplôme en sciences naturelles à l'Université de Lausanne en 1986, puis un master ès sciences en biologie en 1988. Il devient docteur en zoologie à l'Université de Lausanne en 1994 en soutenant sa thèse «Zoogéographie et taxonomie des Crocidurinés d'Asie du Sud-Est (Insectivora, Mammalia)», menée sous la direction de Peter Vogel. De 1995 à 1996, il effectue un travail postdoctoral sous la direction de James L. Patton au Museum of Vertebrate Zoology de l'Université de Californie à Berkeley. En 1997, il reçoit une bourse de recherche de la Suisse et revient sur Lausanne, où il est directeur de recherche à l'Institut d'Écologie. Il rejoint le Muséum d'histoire naturelle de Genève en 1999, où il est conservateur en mammalogie et ornithologie depuis 2001.
Le Murin cryptiqueMyotis crypticus Ruedi, Ibáñez, Salicini, Juste & Puechmaille, 2019, ici photographié par son premier descripteur.
La recherche de Manuel Ruedi se concentre sur les reconstructions phylogénétiques et les analyses biogéographiques, notamment basées sur des données moléculaires. Il a également développé plusieurs programmes de recherche sur la génétique des populations et la systématique des chauves-souris. Il a notamment décrit plusieurs taxons de musaraignes et de chauves-souris:
Famille
Cistugidae Lack, Roehrs, Stanley, Ruedi & Van Den Bussche
En 2018, il est l'auteur du chapitre sur les musaraignes (Soricidae) dans le huitième volume de l'encyclopédie de référence Handbook of the Mammals of the World; en 2019 il contribue au neuvième et dernier volume de la série, sur les chauves-souris, en écrivant la monographie sur les Cistugidae.
Publications
Manuel Ruedi est l'auteur de nombreuses publications, dont:
(en) Andrew M Durso, Rafael Ruiz de Castañeda, Camille Montalcini, M Rosa Mondardini, Jose L Fernandez-Marques, François Grey, Martin M Müller, Peter Uetz, Benjamin M Marshall, Russell J Gray, Christopher E Smith, Donald Becker, Michael Pingleton, Jose Louies, Arthur D Abegg, Jeannot Akuboy, Gabriel Alcoba, Jennifer C Daltry, Omar M Entiauspe-Neto, Paul Freed, Marco Antonio de Freitas, Xavier Glaudas, Song Huang, Tianqi Huang, Yatin Kalki, Yosuke Kojima, Anne Laudisoit, Kul Prasad Limbu, José G Martínez-Fonseca, Konrad Mebert, Mark-Oliver Rödel, Sara Ruane, Manuel Ruedi, Andreas Schmitz, Sarah A Tatum, Frank Tillack, Avinash Visvanathan, Wolfgang Wüster et Isabelle Bolon, «Citizen science and online data: Opportunities and challenges for snake ecology and action against snakebite», Toxicon X, vol.9-10, , p.100071 (ISSN2590-1710, PMID34278294, PMCID8264216, DOI10.1016/J.TOXCX.2021.100071).
(en) Manuel Ruedi, Uttam Saikia, Adora Thabah, Tamás Görföl, Sanjan Thapa et Gábor Csorba, «Molecular and morphological revision of small Myotinae from the Himalayas shed new light on the poorly known genus Submyotodon (Chiroptera: Vespertilionidae)», Mammalian Biology, Elsevier et Springer Science+Business Media, vol.101, no4, , p.465-480 (ISSN1616-5047 et 1618-1476, DOI10.1007/S42991-020-00081-3).
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