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Le mot marqueur peut désigner en particulier :
- un stylo-feutre qui peut être indélébile ou non ;
- en biologie (voir aussi : Biomarqueur) :
- la biosignature qui indique la présence de vie,
- le marqueur tumoral en médecine, une molécule produite par les cellules cancéreuses,
- plus particulièrement en génétique :
- un gène marqueur, un témoin de la transformation génétique,
- un marqueur génétique, un gène que l'on recherche ;
- en imagerie médicale, un marqueur radioactif, un médicament radiopharmaceutique dont la détection permet d’obtenir des images par scintigraphie ;