En 2017, Matthieu devient l’un des animateurs radio à l’émission du matin à CKOI et devient membre de l’équipe régulière du show du retour animé par Patrick Marsolais. En 2018, il est aussi chroniqueur à l'émission Avec Pas D’Match sur RDS.
En 2020, il joue dans ComediHa! et Juste pour rire avant d’écrire et d’interpréter la série Entre deux draps, diffusée sur Noovo, récompensée en 2021 par plusieurs prix Gémeaux (Meilleure série humoristique et Meilleure interprétation humour) et un Olivier de la meilleure série humoristique en 2022. La série connaît un large succès et entraîne une adaptation anglophone intitulée Pillowtalk. Pepper choisit d’y mettre fin après quatre saisons.
En 2023, Matthieu Pepper lance son premier spectacle solo, En attendant la fête au village, un projet d’écriture personnelle qui aborde des thèmes tels que les relations hommes-femmes, la virilité et le décès de son père en 2017 des suites d’un cancer.
En 2026, il participe à la téléréalité «Nuls en Chef», émission culinaire où 12 humoristes québécois qui n’ont aucun talent de cuisine s’affrontent dans des divers défis.