Période 1994 - 2024
La revue est créée en 1994 et est réalisée par Marc Duquet (responsable de la rédaction), sous la direction éditoriale de Philippe J. Dubois. Le directeur de publication est Allain Bougrain-Dubourg, le président de la Ligue pour la protection des oiseaux (LPO). La revue est publiée sous forme de fascicules périodiques constituant un volume annuel à pagination continue et numérotation interne à chaque volume, en petit format 16 x 22,8 cm. Cette formule a été conservée depuis la création jusqu'en 2024 soit pendant 31 ans,,,.
Cette première période a donné lieu à 169 numéros répartis en 31 volumes annuels. En 1994, deux numéros ont été publiés, puis la revue est devenue trimestrielle dès 1995 et jusqu'au volume 7, en 2000. L'année suivante, à partir du volume 8, elle est devenue bimestrielle. La pagination est variable, environ 50 à 70 pages par fascicule en règle générale,.
En 2016 est sorti un numéro hors-série de 222 pages consacré aux actes d'un colloque sur la Cigogne noire, en partenariat avec l'Office national des forêts.
Depuis 2025
Depuis le début de l'année 2025, la direction de la rédaction est assurée par Philippe Jourde et Guillaume Bruneau en est le rédacteur en chef. Le directeur de publication en est toujours Allain Bougrain-Dubourg. Ornithos est désormais publiée sous la forme d'un magazine trimestriel paginé individuellement, avec une nouvelle charte graphique, en grand format 21 x 27,8 cm. L'organisation en cahiers annuels est abandonnée et les nouvelles sorties sont numérotées à partir de 170, le premier numéro de la nouvelle formule, daté du premier trimestre 2025. Sous sa nouvelle maquette, Ornithos comporte environ 90 pages,.
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