Protaphorurodes tomuraushensis, unique représentant du genre Protaphorurodes, est une espèce de collemboles de la famille des Onychiuridae.
Son nom d'espèce, composé de tomuraush[i] et du suffixe latin -ensis, « qui vit dans, qui habite », lui a été donné en référence au lieu de sa découverte, le mont Tomuraushi.